140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2671 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 
470 aa  937    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1138  DNA/RNA non-specific endonuclease  65.89 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3644  DNA/RNA non-specific endonuclease  53.62 
 
 
279 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0336  DNA/RNA non-specific endonuclease  54.51 
 
 
274 aa  280  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2726  DNA/RNA non-specific endonuclease  56.78 
 
 
269 aa  270  5.9999999999999995e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.564947  normal  0.0294848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4000  DNA/RNA non-specific endonuclease  54.12 
 
 
281 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2616  DNA/RNA non-specific endonuclease  55.51 
 
 
446 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0874115  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6632  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.87 
 
 
289 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.152163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.82 
 
 
420 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08316  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.98 
 
 
471 aa  233  6e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2952  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.49 
 
 
342 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0320896 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.8 
 
 
1266 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.84 
 
 
1075 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.85 
 
 
818 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.85 
 
 
818 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  45.66 
 
 
780 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  45.83 
 
 
780 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.47 
 
 
947 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  48.5 
 
 
948 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.85 
 
 
945 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  47.31 
 
 
948 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.18 
 
 
1092 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.06 
 
 
848 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  47.56 
 
 
948 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  46.71 
 
 
948 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  48.47 
 
 
944 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.24 
 
 
944 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  47.85 
 
 
944 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  47.85 
 
 
944 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.44 
 
 
942 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  47.24 
 
 
944 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.26 
 
 
1091 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.71 
 
 
940 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.42 
 
 
955 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.48 
 
 
283 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.9 
 
 
826 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  46.06 
 
 
614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  40.12 
 
 
1310 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2089  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.32 
 
 
283 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  39.75 
 
 
1346 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00665  putative endonuclease  26.35 
 
 
269 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0795494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.06 
 
 
265 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  40.23 
 
 
617 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0792  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.38 
 
 
356 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.76 
 
 
870 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.76 
 
 
870 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.33 
 
 
870 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.2 
 
 
870 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.08 
 
 
876 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.2 
 
 
870 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.76 
 
 
870 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  40.51 
 
 
871 aa  97.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.76 
 
 
870 aa  97.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.59 
 
 
870 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.94 
 
 
293 aa  94  5e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.95 
 
 
885 aa  93.6  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.04 
 
 
892 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.13 
 
 
871 aa  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  35.75 
 
 
865 aa  88.2  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02818  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.05 
 
 
232 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.62 
 
 
873 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  35.26 
 
 
982 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79520  Mitochondrial nuclease  29.33 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.553306  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0573  endonuclease  28.92 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5415  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.44 
 
 
293 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.19 
 
 
894 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2787  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.29 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.148277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.58 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2047  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  32.84 
 
 
302 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000019362  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.31 
 
 
298 aa  79.7  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2350  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.84 
 
 
302 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000288623  hitchhiker  0.00789181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.83 
 
 
309 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5224  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.82 
 
 
305 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.13 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3924  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.82 
 
 
342 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204737  hitchhiker  0.000259019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1560  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.82 
 
 
305 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.450692  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2295  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.09 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000402922  decreased coverage  0.000101093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.46 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2565  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.55 
 
 
267 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000966984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  37.84 
 
 
275 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6268  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.59 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  35.67 
 
 
869 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.5 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0175  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.57 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000379253  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4899  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.82 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835138  normal  0.203553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1810  nuclease  27.09 
 
 
265 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000251579  unclonable  0.0000000338586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1871  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.33 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000105859  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4799  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.63 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0363  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.94 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4118  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.32 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.75 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7050  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.88 
 
 
211 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0233  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.3 
 
 
268 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02185  endodeoxyribonuclease (Eurofung)  26.34 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.221302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.9 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.24 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  33.14 
 
 
984 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.9 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1618  OB-fold nucleic acid binding domain-containing protein  31.35 
 
 
1710 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0364  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.36 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.761571 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>