95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1937 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 297 aa  587  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  96.3 
 
 		 291 aa  537  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  84.18 
 
 		 291 aa  490  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3461  DNA/RNA non-specific endonuclease  63.57 
 
 		 300 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  61.48 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  59.26 
 
 		 295 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5415  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.26 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2565  DNA/RNA non-specific endonuclease  48.52 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000966984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0233  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.62 
 
 		 268 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0175  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.08 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000379253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2787  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.74 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.148277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1871  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.59 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000105859  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2295  DNA/RNA non-specific endonuclease  46.89 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000402922  decreased coverage  0.000101093 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2047  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  45.33 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000019362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2350  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.44 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000288623  hitchhiker  0.00789181 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4319  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.42 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4118  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.48 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5224  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.78 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1560  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.78 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.450692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02818  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.23 
 
 		 232 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.47 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6268  DNA/RNA non-specific endonuclease  48.28 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7050  DNA/RNA non-specific endonuclease  46.19 
 
 		 211 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.97 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.48 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5192  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.37 
 
 		 235 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  41.1 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3924  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.89 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204737  hitchhiker  0.000259019 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0363  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.04 
 
 		 348 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4799  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.36 
 
 		 359 aa  155  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4899  DNA/RNA non-specific endonuclease  43.01 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835138  normal  0.203553 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0364  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.55 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.761571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2226  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.57 
 
 		 229 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.79 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1212  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.66 
 
 		 348 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4380  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.58 
 
 		 189 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0623  DNA/RNA endonuclease G NUC1-like protein  63.44 
 
 		 148 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.214808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0630  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.92 
 
 		 170 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2089  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.6 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4373  DNA/RNA non-specific endonuclease  54.35 
 
 		 117 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000971862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79520  Mitochondrial nuclease  32.08 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.553306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  34 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29606  predicted protein  29.41 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0259516  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02185  endodeoxyribonuclease (Eurofung)  33.33 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221302 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.71 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03360  nuclease, putative  41.59 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0170398  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00665  putative endonuclease  33.33 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0795494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.36 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0792  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.36 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0697  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.33 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2726  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.46 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.564947  normal  0.0294848 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1075  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.58 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.510114  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0336  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.52 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.29 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1028  endonuclease  37.11 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.56 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0622  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.82 
 
 		 216 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17136  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0934  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.55 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.311565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1138  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.12 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0566  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.26 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00041996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4000  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.69 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.22 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.9 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1441  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.26 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1834  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.38 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3644  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.12 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6229  predicted protein  29.41 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1810  nuclease  27.27 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000251579  unclonable  0.0000000338586 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08316  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.34 
 
 		 471 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0573  endonuclease  25.31 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6632  DNA/RNA non-specific endonuclease  30 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152163 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0090  putative endonuclease  26.47 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.670924  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.25 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1427  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.46 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000987613  decreased coverage  0.000225479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1841  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.46 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000036697  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1459  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.46 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000101242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2014  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.46 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1443  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.78 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2952  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.45 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0320896 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.01 
 
 		 351 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2076  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.33 
 
 		 246 aa  52.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2616  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.85 
 
 		 446 aa  52.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0874115  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.07 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.34 
 
 		 669 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.33 
 
 		 644 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.47 
 
 		 724 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.58 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.86 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  32 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  28.33 
 
 		 642 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.54 
 
 		 301 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.54 
 
 		 301 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.38 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.97 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.93 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>