42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4373 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4373  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 117 aa  243  8e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000971862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0623  DNA/RNA endonuclease G NUC1-like protein  66.37 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.214808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  61.29 
 
 		 295 aa  127  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  57.61 
 
 		 309 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2565  DNA/RNA non-specific endonuclease  53 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000966984  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2350  DNA/RNA non-specific endonuclease  54.26 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000288623  hitchhiker  0.00789181 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2047  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  53.19 
 
 		 302 aa  117  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000019362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  55.43 
 
 		 291 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5415  DNA/RNA non-specific endonuclease  52.17 
 
 		 293 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  53.77 
 
 		 291 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  54.35 
 
 		 297 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0175  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.63 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000379253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1871  DNA/RNA non-specific endonuclease  50.51 
 
 		 263 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000105859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2787  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.66 
 
 		 272 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.148277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0233  DNA/RNA non-specific endonuclease  46.46 
 
 		 268 aa  104  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4118  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.47 
 
 		 249 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2295  DNA/RNA non-specific endonuclease  46 
 
 		 348 aa  100  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000402922  decreased coverage  0.000101093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  52.13 
 
 		 248 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3461  DNA/RNA non-specific endonuclease  54.35 
 
 		 300 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.74 
 
 		 321 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5192  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.66 
 
 		 235 aa  94  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02818  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.65 
 
 		 232 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1212  DNA/RNA non-specific endonuclease  46.6 
 
 		 348 aa  90.9  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7050  DNA/RNA non-specific endonuclease  51.39 
 
 		 211 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  45.16 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.49 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4899  DNA/RNA non-specific endonuclease  43.81 
 
 		 265 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835138  normal  0.203553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2226  DNA/RNA non-specific endonuclease  39 
 
 		 229 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3924  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.3 
 
 		 342 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204737  hitchhiker  0.000259019 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4799  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.2 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4319  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.48 
 
 		 315 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5224  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.24 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1560  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.24 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.450692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.83 
 
 		 283 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6268  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.86 
 
 		 304 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2089  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.86 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0363  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.78 
 
 		 348 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0364  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.91 
 
 		 341 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.761571 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79520  Mitochondrial nuclease  27.78 
 
 		 325 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.553306  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02185  endodeoxyribonuclease (Eurofung)  40.74 
 
 		 334 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221302 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29606  predicted protein  38.18 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0259516  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03360  nuclease, putative  32.97 
 
 		 364 aa  41.2  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0170398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>