58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1035 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 305 aa  593  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  59.62 
 
 		 272 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  50.56 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.18 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.93 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.35 
 
 		 316 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  36.95 
 
 		 631 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.41 
 
 		 644 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  40.7 
 
 		 642 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.91 
 
 		 669 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.04 
 
 		 686 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  39 
 
 		 741 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.51 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.45 
 
 		 721 aa  145  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.99 
 
 		 724 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.31 
 
 		 720 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.46 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.48 
 
 		 701 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.12 
 
 		 422 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.95 
 
 		 743 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.47 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.47 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4799  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.27 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4899  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.8 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835138  normal  0.203553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0792  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.22 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3924  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.78 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204737  hitchhiker  0.000259019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.03 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5192  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.1 
 
 		 235 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02185  endodeoxyribonuclease (Eurofung)  28.57 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7050  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.19 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108993 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4118  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.04 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.65 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5415  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.15 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6268  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.33 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3461  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.64 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.13 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.21 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.99 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  29 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1212  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.48 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.66 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.33 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  32.32 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.71 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1871  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.97 
 
 		 263 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000105859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.41 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.97 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1834  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.65 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1028  endonuclease  31.67 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2565  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.71 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000966984  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.31 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2350  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.6 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000288623  hitchhiker  0.00789181 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2047  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  29.6 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000019362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.63 
 
 		 248 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0233  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.83 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.03 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00665  putative endonuclease  31.96 
 
 		 269 aa  42.7  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0795494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02818  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.89 
 
 		 232 aa  42.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>