46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0924 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 422 aa  879    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.87 
 
 		 301 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.54 
 
 		 301 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  34 
 
 		 631 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.53 
 
 		 316 aa  123  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.8 
 
 		 314 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  32.43 
 
 		 642 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.36 
 
 		 309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.98 
 
 		 644 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.16 
 
 		 311 aa  114  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.68 
 
 		 686 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.3 
 
 		 724 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.48 
 
 		 721 aa  103  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.71 
 
 		 669 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.12 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.7 
 
 		 273 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.94 
 
 		 272 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  31.18 
 
 		 741 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.23 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.45 
 
 		 720 aa  74.3  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.57 
 
 		 743 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.15 
 
 		 701 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0573  endonuclease  29.79 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2588  hypothetical protein  34.07 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0831  hypothetical protein  36.36 
 
 		 334 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.398409  normal  0.103006 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.28 
 
 		 277 aa  57  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.25 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.4 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.37 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3247  hypothetical protein  31.46 
 
 		 340 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.85 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5555  Protein of unknown function DUF2278  33.33 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0090  putative endonuclease  28.71 
 
 		 283 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.670924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2089  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.76 
 
 		 283 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0792  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.9 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  27.78 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4899  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.22 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835138  normal  0.203553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2457  hypothetical protein  28.7 
 
 		 274 aa  47  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.17 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.07 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1810  nuclease  23.81 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000251579  unclonable  0.0000000338586 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4799  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.61 
 
 		 359 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.9 
 
 		 295 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79520  Mitochondrial nuclease  25.89 
 
 		 325 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.553306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.04 
 
 		 298 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29606  predicted protein  22.32 
 
 		 330 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0259516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>