46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0949 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 337 aa  683    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.86 
 
 		 686 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  36.25 
 
 		 642 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.21 
 
 		 644 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  36.63 
 
 		 631 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.77 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.68 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.78 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.64 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.91 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.17 
 
 		 669 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.46 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.47 
 
 		 273 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.77 
 
 		 724 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.12 
 
 		 720 aa  116  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.36 
 
 		 721 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  30.87 
 
 		 741 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.53 
 
 		 701 aa  96.7  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.23 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.24 
 
 		 743 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.32 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.95 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1834  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.57 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.95 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.19 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1841  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.78 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000036697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1427  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.78 
 
 		 284 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000987613  decreased coverage  0.000225479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1459  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.78 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000101242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2014  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.78 
 
 		 284 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1443  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.99 
 
 		 388 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1028  endonuclease  29.44 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600333  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.1 
 
 		 265 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02185  endodeoxyribonuclease (Eurofung)  30 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.11 
 
 		 470 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5192  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.16 
 
 		 235 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.29 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.89 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.39 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.22 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.86 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29606  predicted protein  32.29 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0259516  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.38 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.82 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.54 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4000  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.92 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5415  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.88 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>