67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4436 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 311 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  55.77 
 
 		 316 aa  358  9e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  55.59 
 
 		 314 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.28 
 
 		 309 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  46.61 
 
 		 631 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  46.82 
 
 		 642 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  46.44 
 
 		 644 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  45.05 
 
 		 741 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.39 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.6 
 
 		 721 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.86 
 
 		 686 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.78 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  43.04 
 
 		 669 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.85 
 
 		 272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.63 
 
 		 720 aa  155  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.64 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.02 
 
 		 724 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.7 
 
 		 743 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.22 
 
 		 422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.45 
 
 		 701 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.84 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.63 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.96 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1028  endonuclease  29.67 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600333  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.05 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1138  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.44 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.68 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.17 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.87 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1834  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.12 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08316  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.22 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0336  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.34 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2226  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.7 
 
 		 229 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.07 
 
 		 291 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.62 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.07 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4899  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.17 
 
 		 265 aa  52.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835138  normal  0.203553 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.77 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03360  nuclease, putative  24.89 
 
 		 364 aa  50.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0170398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0573  endonuclease  32.26 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02185  endodeoxyribonuclease (Eurofung)  26.15 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2089  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.23 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5192  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.71 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2076  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.87 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  24.53 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4799  DNA/RNA non-specific endonuclease  25 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.84 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1212  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.44 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4000  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.96 
 
 		 281 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.68 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1459  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.11 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000101242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2014  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.11 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.5 
 
 		 420 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3924  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.67 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204737  hitchhiker  0.000259019 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79520  Mitochondrial nuclease  26.29 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.553306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2726  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.9 
 
 		 269 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.564947  normal  0.0294848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.04 
 
 		 470 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1841  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.11 
 
 		 284 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000036697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1427  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.11 
 
 		 284 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000987613  decreased coverage  0.000225479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.84 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2295  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.03 
 
 		 348 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000402922  decreased coverage  0.000101093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.75 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4380  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.4 
 
 		 189 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29606  predicted protein  23.68 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0259516  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1443  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.11 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3644  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.67 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0792  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.89 
 
 		 356 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.275213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>