92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1138 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1138  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 356 aa  707    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  63.07 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2726  DNA/RNA non-specific endonuclease  54.96 
 
 		 269 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.564947  normal  0.0294848 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  55.74 
 
 		 420 aa  257  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2616  DNA/RNA non-specific endonuclease  52.82 
 
 		 446 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0874115  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4000  DNA/RNA non-specific endonuclease  53.11 
 
 		 281 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3644  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.44 
 
 		 279 aa  239  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0336  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.79 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08316  DNA/RNA non-specific endonuclease  46.96 
 
 		 471 aa  229  7e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2952  DNA/RNA non-specific endonuclease  46.77 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0320896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6632  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.91 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.48 
 
 		 283 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0792  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.16 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2089  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.02 
 
 		 283 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.36 
 
 		 265 aa  106  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00665  putative endonuclease  30.18 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0795494  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.74 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5415  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.62 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02818  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.1 
 
 		 232 aa  94  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2350  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.13 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000288623  hitchhiker  0.00789181 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0363  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.07 
 
 		 348 aa  90.1  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2047  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  31.5 
 
 		 302 aa  89.7  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000019362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.62 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  34.5 
 
 		 275 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5192  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.84 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2565  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.72 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000966984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2787  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.47 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.148277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.64 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4799  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.7 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1871  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.41 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000105859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.99 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79520  Mitochondrial nuclease  25.91 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.553306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0364  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.18 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.761571 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  30 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3924  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.78 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204737  hitchhiker  0.000259019 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6268  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.34 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0233  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.9 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2295  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.59 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000402922  decreased coverage  0.000101093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4118  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.48 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0175  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.03 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000379253  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1560  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.1 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.450692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5224  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.1 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1028  endonuclease  26.2 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.58 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7050  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.06 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.36 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.12 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.68 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.12 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.83 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1075  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.65 
 
 		 216 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.510114  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1834  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.43 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0934  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.2 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.311565  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2226  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.7 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4899  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.48 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835138  normal  0.203553 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0697  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.78 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0622  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.78 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17136  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03360  nuclease, putative  29.3 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0170398  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02185  endodeoxyribonuclease (Eurofung)  25.79 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221302 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0566  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.11 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00041996  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1441  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.86 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3461  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.75 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.61 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.35 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0573  endonuclease  25.11 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.07 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0090  putative endonuclease  30.36 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.670924  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4319  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.79 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.23 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0630  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.04 
 
 		 170 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1212  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.63 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29606  predicted protein  34.34 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0259516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1810  nuclease  26.96 
 
 		 265 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000251579  unclonable  0.0000000338586 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6229  predicted protein  33.03 
 
 		 224 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4380  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.97 
 
 		 189 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2076  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.6 
 
 		 246 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.9 
 
 		 644 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  56.94 
 
 		 914 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  25.9 
 
 		 642 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.92 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  39.18 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.03 
 
 		 686 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.99 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.26 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  45.83 
 
 		 433 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  42.03 
 
 		 338 aa  46.2  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  48.78 
 
 		 830 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  43.01 
 
 		 1394 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  43.64 
 
 		 455 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  40.74 
 
 		 676 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  53.19 
 
 		 628 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0623  DNA/RNA endonuclease G NUC1-like protein  34.94 
 
 		 148 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.214808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>