86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5415 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5415  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  51 
 
 		 295 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.39 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.26 
 
 		 291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.26 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0175  DNA/RNA non-specific endonuclease  46.12 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000379253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1871  DNA/RNA non-specific endonuclease  50 
 
 		 263 aa  249  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000105859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2565  DNA/RNA non-specific endonuclease  48.44 
 
 		 267 aa  248  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000966984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0233  DNA/RNA non-specific endonuclease  46.67 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.21 
 
 		 291 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2787  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.71 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.148277  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3461  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.81 
 
 		 300 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4118  DNA/RNA non-specific endonuclease  48.29 
 
 		 249 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2047  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  43.31 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000019362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2350  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.44 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000288623  hitchhiker  0.00789181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2295  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.63 
 
 		 348 aa  211  9e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000402922  decreased coverage  0.000101093 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4319  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.08 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1560  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.19 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.450692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5224  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.19 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7050  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.52 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.12 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6268  DNA/RNA non-specific endonuclease  43.91 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.25 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5192  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.22 
 
 		 235 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  46.08 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.12 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02818  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.8 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3924  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.5 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204737  hitchhiker  0.000259019 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4799  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.84 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1212  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.43 
 
 		 348 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0363  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.09 
 
 		 348 aa  155  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0364  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.51 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.761571 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4899  DNA/RNA non-specific endonuclease  43.59 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835138  normal  0.203553 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4380  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.51 
 
 		 189 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0630  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.79 
 
 		 170 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.76 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2226  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.62 
 
 		 229 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2089  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.76 
 
 		 283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0623  DNA/RNA endonuclease G NUC1-like protein  49.11 
 
 		 148 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.214808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4373  DNA/RNA non-specific endonuclease  49.06 
 
 		 117 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000971862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79520  Mitochondrial nuclease  31.46 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.553306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1138  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.62 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1834  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.88 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.06 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.72 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00665  putative endonuclease  28.96 
 
 		 269 aa  89.4  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0795494  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0336  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.87 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.24 
 
 		 420 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.94 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.08 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0792  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.34 
 
 		 356 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.275213 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02185  endodeoxyribonuclease (Eurofung)  33.56 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.44 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.42 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29606  predicted protein  28.1 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0259516  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1028  endonuclease  36.36 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600333  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4000  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.95 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0573  endonuclease  30.16 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2726  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.21 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.564947  normal  0.0294848 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0934  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.78 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.311565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2616  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.56 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0874115  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0566  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.11 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00041996  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3644  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.28 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1441  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.03 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2952  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.77 
 
 		 342 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0320896 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1075  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.21 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.510114  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0697  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.01 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0622  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.01 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17136  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03360  nuclease, putative  34.65 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0170398  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0090  putative endonuclease  26.48 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.670924  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1810  nuclease  26.58 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000251579  unclonable  0.0000000338586 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6229  predicted protein  25 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1841  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.47 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000036697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2014  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.47 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1459  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.47 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000101242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1427  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.47 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000987613  decreased coverage  0.000225479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6632  DNA/RNA non-specific endonuclease  26 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08316  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.54 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.07 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1443  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.47 
 
 		 388 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.87 
 
 		 273 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2076  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.1 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.53 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.15 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.37 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.88 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>