77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0363 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0363  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 348 aa  718    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0364  DNA/RNA non-specific endonuclease  71.68 
 
 		 341 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.761571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3924  DNA/RNA non-specific endonuclease  50.47 
 
 		 342 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204737  hitchhiker  0.000259019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  50.89 
 
 		 297 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5192  DNA/RNA non-specific endonuclease  49.07 
 
 		 235 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  52.13 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  51.4 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4799  DNA/RNA non-specific endonuclease  48.13 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  49.29 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1212  DNA/RNA non-specific endonuclease  39 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4899  DNA/RNA non-specific endonuclease  49.46 
 
 		 265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835138  normal  0.203553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.91 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2350  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.18 
 
 		 302 aa  159  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000288623  hitchhiker  0.00789181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.31 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2047  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  42.86 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000019362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.47 
 
 		 291 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.04 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5415  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.09 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0233  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.19 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.54 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2295  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.65 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000402922  decreased coverage  0.000101093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4118  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.06 
 
 		 249 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1871  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.05 
 
 		 263 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000105859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0175  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.36 
 
 		 268 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000379253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2565  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.48 
 
 		 267 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000966984  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7050  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.64 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3461  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.5 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2787  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.52 
 
 		 272 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.148277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  35 
 
 		 283 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6268  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.83 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02818  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.86 
 
 		 232 aa  119  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4319  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.09 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2089  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.95 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2226  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.26 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1560  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.4 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.450692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5224  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.4 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1138  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.44 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.36 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  35 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0630  DNA/RNA non-specific endonuclease  43.3 
 
 		 170 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0792  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.25 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.06 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00665  putative endonuclease  32.67 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0795494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2671  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.69 
 
 		 470 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0295423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3644  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.11 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2726  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.65 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.564947  normal  0.0294848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4000  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.89 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02185  endodeoxyribonuclease (Eurofung)  32.9 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221302 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29606  predicted protein  35.43 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0259516  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0336  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.09 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4380  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.82 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2952  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.7 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0320896 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1834  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.47 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79520  Mitochondrial nuclease  31.45 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.553306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6229  predicted protein  33 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6632  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.35 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0623  DNA/RNA endonuclease G NUC1-like protein  43.48 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.214808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4373  DNA/RNA non-specific endonuclease  37 
 
 		 117 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000971862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03360  nuclease, putative  29.41 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0170398  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.87 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2616  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.5 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0874115  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1075  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.41 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.510114  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0622  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.63 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17136  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0697  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.63 
 
 		 216 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.68 
 
 		 277 aa  53.5  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0566  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.98 
 
 		 217 aa  52.8  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.00041996  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08316  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.93 
 
 		 471 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1441  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.43 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0934  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.78 
 
 		 217 aa  50.4  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.311565  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2076  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.06 
 
 		 246 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.37 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.32 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1028  endonuclease  26.25 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.81 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1810  nuclease  25.32 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000251579  unclonable  0.0000000338586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0573  endonuclease  30.53 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.73 
 
 		 273 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>