130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4013 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.73 
 
 		 940 aa  646    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.34 
 
 		 821 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 810 aa  1618    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1932  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.29 
 
 		 802 aa  617  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  42.64 
 
 		 802 aa  504  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.85 
 
 		 592 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3663  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  41.3 
 
 		 586 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00731274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.54 
 
 		 647 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.68 
 
 		 1073 aa  333  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  38.14 
 
 		 1076 aa  310  5.9999999999999995e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.74 
 
 		 788 aa  299  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.83 
 
 		 788 aa  299  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.08 
 
 		 788 aa  296  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.74 
 
 		 788 aa  296  9e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.74 
 
 		 788 aa  296  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.91 
 
 		 788 aa  295  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.91 
 
 		 788 aa  295  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.5 
 
 		 788 aa  294  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.74 
 
 		 788 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.74 
 
 		 583 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.95 
 
 		 790 aa  287  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0085  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 		 598 aa  281  5e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09210)  34.18 
 
 		 600 aa  277  7e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.25 
 
 		 1052 aa  276  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.09 
 
 		 1795 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.93 
 
 		 597 aa  260  8e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  31.19 
 
 		 795 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  47.22 
 
 		 1591 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.45 
 
 		 929 aa  185  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  47.33 
 
 		 1652 aa  182  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  42.41 
 
 		 1577 aa  157  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  41.69 
 
 		 1577 aa  146  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04221  nuclease  49.16 
 
 		 297 aa  127  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512426  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.14 
 
 		 1525 aa  125  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1553  hypothetical protein  43.35 
 
 		 277 aa  124  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29 
 
 		 601 aa  122  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  35.09 
 
 		 902 aa  120  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1096  hypothetical protein  42.64 
 
 		 581 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  37.14 
 
 		 1512 aa  118  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.18 
 
 		 870 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.36 
 
 		 870 aa  108  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.18 
 
 		 870 aa  108  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.76 
 
 		 870 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.09 
 
 		 1091 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.97 
 
 		 876 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.49 
 
 		 942 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.58 
 
 		 870 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  24.82 
 
 		 871 aa  99.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.49 
 
 		 573 aa  99.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.46 
 
 		 870 aa  98.6  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.11 
 
 		 1148 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.25 
 
 		 870 aa  98.2  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.05 
 
 		 1266 aa  95.9  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.64 
 
 		 1092 aa  96.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.87 
 
 		 1075 aa  90.9  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.75 
 
 		 1148 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  24.48 
 
 		 865 aa  87.8  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.95 
 
 		 873 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  23.86 
 
 		 890 aa  84  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 		 947 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 		 871 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.94 
 
 		 826 aa  80.1  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.35 
 
 		 885 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  24.19 
 
 		 984 aa  78.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.99 
 
 		 2346 aa  77.8  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.51 
 
 		 870 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  29.94 
 
 		 869 aa  74.7  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  24.49 
 
 		 982 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  25.34 
 
 		 2796 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.43 
 
 		 868 aa  67.4  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.22 
 
 		 892 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.23 
 
 		 955 aa  66.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  25.08 
 
 		 624 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  27.1 
 
 		 948 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  25.08 
 
 		 624 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  25.08 
 
 		 624 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.08 
 
 		 624 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.08 
 
 		 624 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.08 
 
 		 624 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  27.59 
 
 		 948 aa  64.7  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  40.3 
 
 		 780 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  38.18 
 
 		 948 aa  62  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.03 
 
 		 940 aa  60.8  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  26.27 
 
 		 514 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  25.21 
 
 		 622 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.83 
 
 		 942 aa  60.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  39.47 
 
 		 780 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.16 
 
 		 1010 aa  60.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.84 
 
 		 1284 aa  58.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.11 
 
 		 894 aa  58.9  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  40.24 
 
 		 948 aa  58.2  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  22.96 
 
 		 945 aa  58.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  23.23 
 
 		 1310 aa  57.4  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.76 
 
 		 1641 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  41.82 
 
 		 1506 aa  56.2  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.07 
 
 		 481 aa  55.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.84 
 
 		 604 aa  54.7  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.84 
 
 		 604 aa  54.7  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  34.41 
 
 		 944 aa  54.7  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.84 
 
 		 604 aa  54.7  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>