132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5836 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
592 aa  1182    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3663  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  46.41 
 
 
586 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00731274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.4 
 
 
821 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.23 
 
 
940 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  45.61 
 
 
802 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.85 
 
 
810 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.57 
 
 
647 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.88 
 
 
1073 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1932  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.59 
 
 
802 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  40.74 
 
 
1076 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.77 
 
 
790 aa  360  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.53 
 
 
788 aa  351  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.36 
 
 
1052 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.67 
 
 
788 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  37.5 
 
 
788 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  38.01 
 
 
788 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  37.67 
 
 
788 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.5 
 
 
788 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.67 
 
 
788 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.67 
 
 
583 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  37.16 
 
 
788 aa  340  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.16 
 
 
788 aa  339  7e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0085  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.21 
 
 
598 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09210)  36.15 
 
 
600 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174042  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.01 
 
 
1795 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.62 
 
 
597 aa  280  6e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.32 
 
 
1266 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.84 
 
 
601 aa  134  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  27.52 
 
 
780 aa  120  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.52 
 
 
947 aa  112  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  27.99 
 
 
780 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.82 
 
 
944 aa  110  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  27.05 
 
 
944 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  26.15 
 
 
948 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  26.4 
 
 
944 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  27.27 
 
 
944 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.08 
 
 
573 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  25.58 
 
 
948 aa  107  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.36 
 
 
945 aa  107  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  26.92 
 
 
944 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.52 
 
 
1641 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  26.1 
 
 
795 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.69 
 
 
1075 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  24.11 
 
 
948 aa  100  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  25.46 
 
 
948 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.09 
 
 
586 aa  97.8  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.12 
 
 
870 aa  97.8  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  23.16 
 
 
1310 aa  94.7  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.01 
 
 
870 aa  94.7  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.19 
 
 
870 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.04 
 
 
870 aa  93.6  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.19 
 
 
942 aa  93.2  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.19 
 
 
870 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.5 
 
 
894 aa  92.8  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  25.04 
 
 
871 aa  91.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.09 
 
 
2346 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.96 
 
 
1525 aa  92  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.4 
 
 
868 aa  91.3  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.78 
 
 
870 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.45 
 
 
870 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.08 
 
 
826 aa  90.5  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.51 
 
 
1641 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  26.7 
 
 
622 aa  88.6  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.71 
 
 
873 aa  88.6  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  25.9 
 
 
624 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.29 
 
 
929 aa  88.2  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  25.9 
 
 
624 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  25.9 
 
 
624 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.9 
 
 
624 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.9 
 
 
624 aa  88.2  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.41 
 
 
876 aa  87.8  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.89 
 
 
1284 aa  87.8  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.82 
 
 
641 aa  87  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.35 
 
 
1148 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.74 
 
 
624 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.54 
 
 
1148 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.66 
 
 
870 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.93 
 
 
871 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.54 
 
 
603 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.5 
 
 
818 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.08 
 
 
942 aa  82.4  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 
1091 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.21 
 
 
1052 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  24.96 
 
 
1346 aa  81.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.78 
 
 
940 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  24.41 
 
 
865 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  24.65 
 
 
572 aa  80.5  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.17 
 
 
1092 aa  80.5  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.8 
 
 
604 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.8 
 
 
604 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.8 
 
 
604 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  23.57 
 
 
945 aa  77.4  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.7 
 
 
848 aa  76.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  25.11 
 
 
1512 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  23.51 
 
 
2796 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  24.59 
 
 
2775 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.82 
 
 
885 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.04 
 
 
604 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  25.89 
 
 
1577 aa  74.7  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  25.38 
 
 
863 aa  74.3  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>