143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5343 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1932  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.88 
 
 
802 aa  792    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
940 aa  1880    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.99 
 
 
821 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.84 
 
 
810 aa  659    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  44.07 
 
 
802 aa  547  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.23 
 
 
592 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3663  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  44.9 
 
 
586 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00731274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.29 
 
 
647 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.17 
 
 
1073 aa  357  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.76 
 
 
788 aa  330  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  36.78 
 
 
788 aa  325  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.59 
 
 
788 aa  324  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  36.59 
 
 
788 aa  323  7e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.59 
 
 
583 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.59 
 
 
788 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.76 
 
 
788 aa  322  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  38.75 
 
 
1076 aa  320  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  36.42 
 
 
788 aa  319  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.26 
 
 
788 aa  318  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.87 
 
 
790 aa  317  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  36.05 
 
 
788 aa  314  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09210)  36.83 
 
 
600 aa  296  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174042  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.83 
 
 
1795 aa  292  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0085  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 
598 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.86 
 
 
1052 aa  261  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.32 
 
 
597 aa  253  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  30.57 
 
 
795 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.22 
 
 
929 aa  187  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  48.92 
 
 
1652 aa  181  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  42.58 
 
 
1591 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  46.29 
 
 
1577 aa  164  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  41.64 
 
 
1577 aa  163  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04221  nuclease  48.28 
 
 
297 aa  148  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1553  hypothetical protein  43.96 
 
 
277 aa  139  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.47 
 
 
1525 aa  132  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  33.14 
 
 
1512 aa  126  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.31 
 
 
942 aa  125  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.28 
 
 
947 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.88 
 
 
601 aa  119  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.58 
 
 
885 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1096  hypothetical protein  43.55 
 
 
581 aa  115  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  25.97 
 
 
871 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  24.77 
 
 
948 aa  110  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  25.96 
 
 
865 aa  108  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.84 
 
 
870 aa  107  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  24.46 
 
 
780 aa  107  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.64 
 
 
870 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  24.42 
 
 
948 aa  104  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.31 
 
 
876 aa  104  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  39.44 
 
 
1426 aa  104  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  33.45 
 
 
902 aa  103  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  24.86 
 
 
948 aa  103  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 
1091 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.53 
 
 
870 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.4 
 
 
870 aa  101  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.65 
 
 
945 aa  101  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.06 
 
 
573 aa  101  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.97 
 
 
870 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  41.67 
 
 
1422 aa  99.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.86 
 
 
870 aa  99  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.86 
 
 
870 aa  98.6  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.64 
 
 
870 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  25.5 
 
 
890 aa  97.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.38 
 
 
1092 aa  96.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  26.11 
 
 
944 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  25.81 
 
 
944 aa  96.3  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  40.97 
 
 
1427 aa  95.9  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  25.65 
 
 
944 aa  95.1  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  25.81 
 
 
944 aa  94.7  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  27.29 
 
 
1346 aa  93.6  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  25 
 
 
2667 aa  92.8  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24 
 
 
955 aa  92.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.04 
 
 
868 aa  92.4  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.99 
 
 
940 aa  92  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.73 
 
 
944 aa  92  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  25.24 
 
 
948 aa  90.9  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.37 
 
 
894 aa  89.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  23.94 
 
 
1310 aa  89  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  24.53 
 
 
869 aa  88.2  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.31 
 
 
892 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.39 
 
 
873 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  24.38 
 
 
780 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.13 
 
 
871 aa  84.7  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2872  Peptidase M64, IgA  35.67 
 
 
785 aa  81.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.62 
 
 
826 aa  80.9  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.08 
 
 
2346 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  25.37 
 
 
984 aa  80.9  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  25.47 
 
 
1503 aa  77.8  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  37.33 
 
 
1019 aa  75.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.01 
 
 
603 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.39 
 
 
604 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  25.42 
 
 
2796 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.46 
 
 
604 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.53 
 
 
1075 aa  71.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.66 
 
 
604 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.66 
 
 
604 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.81 
 
 
604 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.84 
 
 
481 aa  69.7  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.69 
 
 
1266 aa  68.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.3 
 
 
586 aa  67.4  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>