132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0195 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.85 
 
 		 810 aa  747    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1932  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.67 
 
 		 802 aa  728    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.04 
 
 		 940 aa  763    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 821 aa  1644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  45.89 
 
 		 802 aa  564  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.4 
 
 		 592 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3663  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  41.46 
 
 		 586 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00731274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.64 
 
 		 647 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  37.74 
 
 		 788 aa  347  7e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.39 
 
 		 788 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.57 
 
 		 788 aa  346  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.39 
 
 		 583 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  37.22 
 
 		 788 aa  342  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.04 
 
 		 788 aa  341  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  37.22 
 
 		 788 aa  341  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.22 
 
 		 788 aa  340  9e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.22 
 
 		 788 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.55 
 
 		 1073 aa  335  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  36.52 
 
 		 788 aa  332  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.14 
 
 		 790 aa  323  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  36.93 
 
 		 1076 aa  306  8.000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0085  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.98 
 
 		 598 aa  276  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.27 
 
 		 1052 aa  272  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.48 
 
 		 1795 aa  265  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 		 597 aa  260  8e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09210)  31.93 
 
 		 600 aa  251  4e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  31.05 
 
 		 795 aa  211  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  44.07 
 
 		 1591 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.56 
 
 		 929 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  40.4 
 
 		 1577 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  41.21 
 
 		 1652 aa  173  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  42.22 
 
 		 1577 aa  159  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04221  nuclease  49.44 
 
 		 297 aa  141  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512426  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.4 
 
 		 1525 aa  126  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  33.01 
 
 		 902 aa  113  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.18 
 
 		 1266 aa  113  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.92 
 
 		 601 aa  110  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1553  hypothetical protein  39.23 
 
 		 277 aa  106  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  36.81 
 
 		 1512 aa  105  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1096  hypothetical protein  40.54 
 
 		 581 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122577  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.13 
 
 		 942 aa  103  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.16 
 
 		 573 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.67 
 
 		 947 aa  102  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  27.07 
 
 		 948 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  26.42 
 
 		 948 aa  97.4  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  25.94 
 
 		 948 aa  95.9  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.47 
 
 		 1284 aa  94  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  26.51 
 
 		 944 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  25.09 
 
 		 780 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  26.78 
 
 		 944 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.43 
 
 		 826 aa  89  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  28.11 
 
 		 780 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.27 
 
 		 944 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  26.63 
 
 		 944 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  26.78 
 
 		 944 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.05 
 
 		 945 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.07 
 
 		 870 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.66 
 
 		 848 aa  84.7  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.56 
 
 		 876 aa  82  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.02 
 
 		 942 aa  82  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.75 
 
 		 870 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  22.1 
 
 		 871 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  22.77 
 
 		 869 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  25.71 
 
 		 948 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.75 
 
 		 870 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.12 
 
 		 940 aa  79  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.55 
 
 		 870 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  23.27 
 
 		 865 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.3 
 
 		 955 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.78 
 
 		 1092 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.82 
 
 		 868 aa  75.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.11 
 
 		 1075 aa  75.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.42 
 
 		 818 aa  75.1  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.03 
 
 		 892 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  27.6 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 		 818 aa  74.3  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.38 
 
 		 604 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  25.81 
 
 		 2775 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.64 
 
 		 1641 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.39 
 
 		 871 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  27.12 
 
 		 622 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.44 
 
 		 894 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.04 
 
 		 604 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.16 
 
 		 1148 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  22.79 
 
 		 982 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.38 
 
 		 603 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  25.3 
 
 		 2667 aa  68.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.24 
 
 		 604 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  26.92 
 
 		 624 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  26.92 
 
 		 624 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  26.92 
 
 		 624 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.92 
 
 		 624 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.92 
 
 		 624 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.55 
 
 		 1091 aa  67.8  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 2346 aa  67.4  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  26.24 
 
 		 1346 aa  67.8  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  22.78 
 
 		 1310 aa  67.4  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.9 
 
 		 604 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.9 
 
 		 604 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.9 
 
 		 604 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>