189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0601 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  64.03 
 
 		 1012 aa  1055    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 1118 aa  2215    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  89.5 
 
 		 1113 aa  1901    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  83.07 
 
 		 1340 aa  1593    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  84.25 
 
 		 889 aa  1424    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  71.79 
 
 		 2194 aa  764    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.28 
 
 		 1009 aa  746    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  83.18 
 
 		 1222 aa  1588    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  82.06 
 
 		 1225 aa  1566    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.55 
 
 		 891 aa  610  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  57.79 
 
 		 1019 aa  358  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  46.53 
 
 		 1838 aa  282  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.46 
 
 		 1800 aa  280  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.95 
 
 		 1661 aa  247  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  42.39 
 
 		 1037 aa  235  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.2 
 
 		 1269 aa  231  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  40.37 
 
 		 2807 aa  230  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.99 
 
 		 1269 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  45.03 
 
 		 386 aa  228  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  41.51 
 
 		 828 aa  218  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  37.14 
 
 		 1557 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  41.9 
 
 		 872 aa  201  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  41.38 
 
 		 412 aa  201  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  30.36 
 
 		 1029 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.13 
 
 		 1029 aa  197  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.11 
 
 		 928 aa  197  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  41.5 
 
 		 1126 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  38.84 
 
 		 974 aa  181  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  39.41 
 
 		 644 aa  178  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  32.72 
 
 		 2310 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  39.23 
 
 		 813 aa  176  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  36.39 
 
 		 554 aa  174  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  33.42 
 
 		 2305 aa  173  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  40.35 
 
 		 604 aa  170  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  39.83 
 
 		 1490 aa  170  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  38.85 
 
 		 1275 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  38.32 
 
 		 662 aa  169  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  29.57 
 
 		 4379 aa  168  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1289 aa  163  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.48 
 
 		 3396 aa  159  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.82 
 
 		 768 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  28.19 
 
 		 5899 aa  153  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  33.33 
 
 		 616 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.23 
 
 		 1415 aa  128  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  30.13 
 
 		 472 aa  111  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  33.24 
 
 		 485 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  32.97 
 
 		 469 aa  108  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  35.23 
 
 		 663 aa  106  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  33.43 
 
 		 494 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.51 
 
 		 1180 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  27.23 
 
 		 4013 aa  99.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  25.14 
 
 		 2127 aa  99.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  33.06 
 
 		 1124 aa  95.9  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.93 
 
 		 3197 aa  95.9  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  36.69 
 
 		 5444 aa  90.5  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  31.96 
 
 		 685 aa  90.1  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  49.56 
 
 		 161 aa  90.5  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  33.53 
 
 		 657 aa  88.2  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.62 
 
 		 3197 aa  88.2  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  35.62 
 
 		 7149 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  36.45 
 
 		 894 aa  84.7  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2106  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1058 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.866139  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.34 
 
 		 11716 aa  82.8  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.61 
 
 		 3168 aa  82.4  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  26.99 
 
 		 8871 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.54 
 
 		 647 aa  80.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  39.25 
 
 		 894 aa  80.1  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  38.79 
 
 		 1594 aa  74.7  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  38.79 
 
 		 1156 aa  74.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  25.38 
 
 		 2042 aa  74.3  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.35 
 
 		 255 aa  72.8  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  36.11 
 
 		 863 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5616  hypothetical protein  33.13 
 
 		 427 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  31.4 
 
 		 447 aa  72  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  36.43 
 
 		 2334 aa  72  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  27.91 
 
 		 2251 aa  72  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.95 
 
 		 5098 aa  71.6  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  31.52 
 
 		 2796 aa  71.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  38.68 
 
 		 2632 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  37.63 
 
 		 837 aa  71.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.13 
 
 		 959 aa  71.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  27.89 
 
 		 510 aa  70.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  25.62 
 
 		 4848 aa  68.6  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40 
 
 		 547 aa  68.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  29.85 
 
 		 1527 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0736  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.87 
 
 		 1021 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.51 
 
 		 1091 aa  67  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  35.09 
 
 		 715 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  25.29 
 
 		 1031 aa  65.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.31 
 
 		 615 aa  65.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  30.86 
 
 		 1022 aa  65.1  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  30.17 
 
 		 1053 aa  64.7  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  45.95 
 
 		 934 aa  62.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.85 
 
 		 1092 aa  62  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1638 aa  60.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  34.65 
 
 		 16311 aa  61.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.53 
 
 		 2281 aa  60.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  30 
 
 		 1346 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.22 
 
 		 354 aa  60.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  27.02 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>