57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1355 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  100 
 
 		 1638 aa  3233    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6179  peptidase M12A astacin  46.77 
 
 		 615 aa  323  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0299292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3161  FG-GAP repeat protein  36.5 
 
 		 753 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000585686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2935  FG-GAP repeat protein  34.72 
 
 		 749 aa  151  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  33.49 
 
 		 1126 aa  133  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  34.88 
 
 		 1490 aa  125  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  31.47 
 
 		 1124 aa  105  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  33.25 
 
 		 604 aa  103  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  29.26 
 
 		 828 aa  82.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.09 
 
 		 1222 aa  80.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.93 
 
 		 2807 aa  81.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  29 
 
 		 1019 aa  79  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  32.17 
 
 		 974 aa  78.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.23 
 
 		 2194 aa  77.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.72 
 
 		 1838 aa  72.8  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.43 
 
 		 1225 aa  72  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.93 
 
 		 1340 aa  70.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  31.77 
 
 		 1275 aa  65.9  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  27.75 
 
 		 1557 aa  65.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  28.29 
 
 		 463 aa  63.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1289 aa  63.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  30.63 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.2 
 
 		 891 aa  60.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.14 
 
 		 1118 aa  60.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  28.16 
 
 		 469 aa  58.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  28.48 
 
 		 3197 aa  57.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.09 
 
 		 1113 aa  55.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  30.52 
 
 		 1976 aa  55.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.64 
 
 		 889 aa  55.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  30.48 
 
 		 554 aa  55.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.66 
 
 		 621 aa  54.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  29.68 
 
 		 720 aa  53.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  31.71 
 
 		 386 aa  53.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  28.25 
 
 		 494 aa  52  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  28.36 
 
 		 412 aa  51.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30.14 
 
 		 3197 aa  51.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  31.68 
 
 		 616 aa  50.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.18 
 
 		 11716 aa  50.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  31.75 
 
 		 685 aa  50.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1127 aa  49.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  27.53 
 
 		 760 aa  50.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  31.18 
 
 		 657 aa  49.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.86 
 
 		 1009 aa  49.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08314  conserved hypothetical protein  29.68 
 
 		 1282 aa  48.9  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  35.33 
 
 		 872 aa  49.3  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  28.41 
 
 		 404 aa  49.3  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  28.49 
 
 		 371 aa  48.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  28.62 
 
 		 485 aa  47.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.11 
 
 		 794 aa  47.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  27.86 
 
 		 2510 aa  47  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09260  conserved hypothetical protein  30.25 
 
 		 869 aa  46.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0483373  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  26.16 
 
 		 539 aa  46.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2042  hypothetical protein  29.17 
 
 		 373 aa  45.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  26.62 
 
 		 472 aa  45.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00921  BNR/Asp-box repeat protein  25.26 
 
 		 1084 aa  45.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06464  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03170)  28.24 
 
 		 921 aa  45.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  26.92 
 
 		 2652 aa  45.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>