More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29131 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  100 
 
 
934 aa  1879    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.67 
 
 
3427 aa  101  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  41.06 
 
 
938 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  42.69 
 
 
1363 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.55 
 
 
1963 aa  92  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  41.45 
 
 
2105 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  51 
 
 
4723 aa  89.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  43.61 
 
 
257 aa  89.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  37.33 
 
 
1279 aa  86.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  35.91 
 
 
639 aa  85.9  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.29 
 
 
980 aa  84.7  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  41.98 
 
 
1424 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.79 
 
 
1795 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  37.59 
 
 
1534 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.98 
 
 
1016 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 
709 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  40 
 
 
2145 aa  83.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  38.24 
 
 
243 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  43.42 
 
 
833 aa  82.4  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  34.29 
 
 
260 aa  82  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
5171 aa  81.6  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  33.5 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  39.74 
 
 
946 aa  81.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  37.63 
 
 
3954 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  34.47 
 
 
1164 aa  80.5  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  42.96 
 
 
744 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  41.13 
 
 
2954 aa  80.9  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.84 
 
 
2668 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  34.64 
 
 
724 aa  79.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  39.64 
 
 
1883 aa  79  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  39.44 
 
 
460 aa  79  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  39.16 
 
 
4334 aa  78.6  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  39.52 
 
 
757 aa  78.2  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  34.67 
 
 
460 aa  78.2  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  30.51 
 
 
950 aa  77.8  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  37.99 
 
 
1532 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  37.84 
 
 
2342 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  36.6 
 
 
491 aa  77.4  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  37.84 
 
 
2342 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  36.31 
 
 
850 aa  76.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  35.48 
 
 
2667 aa  76.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.97 
 
 
421 aa  76.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.77 
 
 
588 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  38 
 
 
595 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  41.84 
 
 
202 aa  75.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  41.84 
 
 
202 aa  75.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  42.68 
 
 
219 aa  75.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  35.16 
 
 
795 aa  75.5  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  38.19 
 
 
686 aa  75.1  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.14 
 
 
1499 aa  74.7  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.18 
 
 
1236 aa  74.7  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.25 
 
 
2689 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  35.71 
 
 
4687 aa  74.3  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  36.51 
 
 
2911 aa  73.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  35.91 
 
 
327 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  43.55 
 
 
680 aa  73.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  39.44 
 
 
1175 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  35.4 
 
 
9867 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  44.63 
 
 
1202 aa  73.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 
572 aa  73.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  39.75 
 
 
341 aa  72.8  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  39.84 
 
 
686 aa  72.4  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  33.85 
 
 
742 aa  72.8  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  38.78 
 
 
385 aa  72  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0275  Hemolysin-type calcium-binding region  37.01 
 
 
206 aa  72  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  31.45 
 
 
717 aa  71.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  32.68 
 
 
4798 aa  71.2  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  38.82 
 
 
245 aa  70.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  39.17 
 
 
867 aa  70.5  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  31.85 
 
 
1287 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  32.08 
 
 
820 aa  70.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
303 aa  70.1  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  40.77 
 
 
219 aa  69.7  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  33.17 
 
 
437 aa  69.7  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  31.58 
 
 
982 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  32.09 
 
 
1544 aa  69.7  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  38.96 
 
 
606 aa  69.7  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  39.87 
 
 
232 aa  69.3  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  39.68 
 
 
526 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  36.16 
 
 
361 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  30.94 
 
 
1625 aa  69.7  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  36.14 
 
 
467 aa  69.3  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  39.83 
 
 
574 aa  68.9  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  32.9 
 
 
1538 aa  68.9  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  36.55 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1354  hypothetical protein  28.16 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  41.75 
 
 
3229 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  42.34 
 
 
620 aa  68.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  33.74 
 
 
728 aa  68.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  39.6 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  39.47 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  34.38 
 
 
1594 aa  68.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  40.68 
 
 
736 aa  68.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  44.34 
 
 
2251 aa  67.8  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  35.86 
 
 
734 aa  68.2  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  41.53 
 
 
1156 aa  67.8  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  35.21 
 
 
2950 aa  67.8  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>