More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1896 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  100 
 
 
574 aa  1164    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1699  hypothetical protein  47.21 
 
 
593 aa  511  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00360282  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1895  hypothetical protein  45.71 
 
 
1025 aa  212  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  34.23 
 
 
2182 aa  118  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.49 
 
 
3977 aa  97.4  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  44.12 
 
 
1424 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  37.24 
 
 
3954 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  32.21 
 
 
768 aa  80.5  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  42.86 
 
 
2775 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  34.17 
 
 
615 aa  77  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.25 
 
 
1180 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  35.82 
 
 
932 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  34.59 
 
 
928 aa  71.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  34.17 
 
 
1805 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  37.6 
 
 
2950 aa  69.7  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  39.83 
 
 
934 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.05 
 
 
2346 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  32.89 
 
 
1764 aa  67  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  35.59 
 
 
5094 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  41.35 
 
 
2342 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  41.35 
 
 
2342 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  28.57 
 
 
2245 aa  64.7  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  38.54 
 
 
1526 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  37.61 
 
 
782 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  40.82 
 
 
421 aa  64.3  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.63 
 
 
2239 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  39.09 
 
 
361 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  39.09 
 
 
361 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  42 
 
 
2911 aa  63.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  49.18 
 
 
6662 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  40.57 
 
 
2105 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.87 
 
 
3427 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.18 
 
 
6683 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  49.18 
 
 
6779 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  45 
 
 
2542 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  34.76 
 
 
7149 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  46.25 
 
 
1814 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  55.56 
 
 
5218 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  38.53 
 
 
713 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  58 
 
 
6753 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  38.53 
 
 
713 aa  62  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.21 
 
 
5962 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  33.81 
 
 
781 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  41.77 
 
 
4687 aa  61.6  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  41.18 
 
 
1538 aa  61.6  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  37.33 
 
 
744 aa  61.6  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  27.35 
 
 
1757 aa  61.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.68 
 
 
1795 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  30.51 
 
 
2097 aa  61.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  37 
 
 
928 aa  60.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  38.75 
 
 
1821 aa  60.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  43.42 
 
 
2537 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  56 
 
 
9030 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.64 
 
 
1236 aa  60.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  40.7 
 
 
1699 aa  60.5  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  56 
 
 
8682 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  56.6 
 
 
855 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  38.75 
 
 
1543 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  43.96 
 
 
2887 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  36.73 
 
 
688 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  35.45 
 
 
361 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  45.35 
 
 
2784 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  36.54 
 
 
486 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5018  Hemolysin-type calcium-binding region  38.89 
 
 
763 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0553928  normal  0.0814089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  50.94 
 
 
1712 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  44.3 
 
 
232 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  37.5 
 
 
1584 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  45.56 
 
 
3314 aa  58.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  42.68 
 
 
3619 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  53.7 
 
 
4285 aa  58.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36 
 
 
588 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  56.86 
 
 
4678 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.61 
 
 
5098 aa  57.8  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  39.71 
 
 
507 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.13 
 
 
595 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  35 
 
 
3587 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  37.36 
 
 
595 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 
2704 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  44.59 
 
 
7284 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  52.08 
 
 
998 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  43 
 
 
709 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  35.85 
 
 
1594 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  50 
 
 
4106 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  35.43 
 
 
1055 aa  57.4  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  53.03 
 
 
243 aa  57.4  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.25 
 
 
5839 aa  57  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.06 
 
 
1372 aa  57  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  39 
 
 
1156 aa  57  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  49.33 
 
 
946 aa  57  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  41.46 
 
 
3619 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  41.58 
 
 
1895 aa  56.6  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  54.24 
 
 
329 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  49.28 
 
 
4798 aa  57  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 
589 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  54.24 
 
 
329 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  49.12 
 
 
728 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  49.3 
 
 
260 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.37 
 
 
2678 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.59 
 
 
1499 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  40.4 
 
 
219 aa  56.2  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>