More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1974 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  94.81 
 
 
1156 aa  2119    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  100 
 
 
1594 aa  3176    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  37.46 
 
 
863 aa  456  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  35.33 
 
 
2632 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  33.86 
 
 
2334 aa  296  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1636  peptidase  28.04 
 
 
800 aa  234  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  37.46 
 
 
715 aa  212  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 
3193 aa  170  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  57.02 
 
 
663 aa  113  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  29.34 
 
 
1289 aa  108  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.37 
 
 
588 aa  104  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  47.54 
 
 
1424 aa  102  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  30.57 
 
 
2062 aa  102  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
946 aa  100  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  44.3 
 
 
1279 aa  98.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
232 aa  97.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  51.43 
 
 
3427 aa  97.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  52.34 
 
 
813 aa  97.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.57 
 
 
1963 aa  95.5  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  44.63 
 
 
5171 aa  92.8  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  55.32 
 
 
202 aa  92.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  55.32 
 
 
202 aa  92.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  50.93 
 
 
4334 aa  91.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  45.11 
 
 
2105 aa  91.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  47.62 
 
 
460 aa  90.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.62 
 
 
2678 aa  90.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 
3954 aa  90.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  45.53 
 
 
757 aa  90.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
572 aa  90.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  57.29 
 
 
260 aa  90.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.07 
 
 
1795 aa  90.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  53.61 
 
 
1164 aa  90.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  43.9 
 
 
795 aa  90.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  52.13 
 
 
709 aa  90.5  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  37.29 
 
 
3619 aa  89.4  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  37.29 
 
 
3619 aa  89  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  40.97 
 
 
219 aa  89  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.65 
 
 
485 aa  88.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  52.69 
 
 
1022 aa  88.6  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  47.22 
 
 
1306 aa  88.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  52.69 
 
 
1017 aa  88.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.45 
 
 
1009 aa  88.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  42.47 
 
 
280 aa  87  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  46.85 
 
 
867 aa  87  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  42.02 
 
 
1383 aa  86.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  44.96 
 
 
1499 aa  85.9  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  46.67 
 
 
2667 aa  85.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  42.98 
 
 
219 aa  85.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  41.78 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  41.09 
 
 
717 aa  85.1  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  45.22 
 
 
355 aa  84.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  48.91 
 
 
1175 aa  85.1  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  43.61 
 
 
1156 aa  84  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  55 
 
 
417 aa  84  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  52.58 
 
 
1814 aa  84.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  46.49 
 
 
595 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.14 
 
 
577 aa  83.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  46.67 
 
 
1363 aa  83.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.89 
 
 
1372 aa  83.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  38.81 
 
 
327 aa  83.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  37.4 
 
 
9867 aa  83.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  40.56 
 
 
491 aa  82.8  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  46.88 
 
 
686 aa  82.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.73 
 
 
2689 aa  82.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  51.04 
 
 
4798 aa  82.4  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.97 
 
 
1016 aa  82  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  36.92 
 
 
613 aa  82  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  44.95 
 
 
2954 aa  82  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  48.24 
 
 
2336 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  55.68 
 
 
4687 aa  81.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  31.68 
 
 
329 aa  81.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  31.68 
 
 
329 aa  81.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  52.27 
 
 
561 aa  81.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  46.79 
 
 
1197 aa  81.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  44.9 
 
 
1287 aa  81.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  37.69 
 
 
606 aa  80.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  49.41 
 
 
4106 aa  80.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  38.81 
 
 
526 aa  80.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.35 
 
 
421 aa  80.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  40.48 
 
 
942 aa  80.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  45.54 
 
 
1526 aa  81.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  33.52 
 
 
3608 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  48.94 
 
 
652 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  53.85 
 
 
1895 aa  80.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  38.26 
 
 
1421 aa  80.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  41.73 
 
 
615 aa  80.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1886  peptidase  26.74 
 
 
827 aa  80.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  45.54 
 
 
850 aa  80.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  47.52 
 
 
833 aa  80.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  50 
 
 
1699 aa  79.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  40 
 
 
980 aa  79.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  46.73 
 
 
679 aa  79.7  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
243 aa  79.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  40.8 
 
 
1534 aa  79.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  40.65 
 
 
769 aa  79.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  43.17 
 
 
833 aa  79.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  42.98 
 
 
982 aa  79.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  46.99 
 
 
525 aa  79.3  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.1 
 
 
891 aa  79.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.85 
 
 
5839 aa  79.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>