70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3594 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  100 
 
 		 485 aa  985    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  39.54 
 
 		 469 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  37.33 
 
 		 494 aa  259  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  37.2 
 
 		 472 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  32.74 
 
 		 1019 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.43 
 
 		 1118 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.16 
 
 		 1340 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  29.48 
 
 		 1838 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.72 
 
 		 891 aa  97.4  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.1 
 
 		 889 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  32.93 
 
 		 1126 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.72 
 
 		 1009 aa  95.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  28.32 
 
 		 1490 aa  94.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.2 
 
 		 2194 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  30.43 
 
 		 974 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  33.24 
 
 		 1275 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  28.65 
 
 		 872 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.19 
 
 		 1225 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  29.14 
 
 		 828 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.12 
 
 		 1222 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.63 
 
 		 1113 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  30.63 
 
 		 813 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  28.61 
 
 		 604 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  30.16 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  31.43 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4122  hypothetical protein  26.91 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  25.26 
 
 		 1557 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.18 
 
 		 2807 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.67 
 
 		 1012 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  31.43 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  31.95 
 
 		 3197 aa  67  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  34.83 
 
 		 3197 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.99 
 
 		 11716 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1289 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  27.31 
 
 		 4379 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  33.33 
 
 		 841 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  30.68 
 
 		 616 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  33.11 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  30.83 
 
 		 1022 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2513  hypothetical protein  33.66 
 
 		 328 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.80929  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  27.93 
 
 		 1124 aa  53.5  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4181  phospholipase C  35.44 
 
 		 522 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.508071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  24.84 
 
 		 524 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  24.82 
 
 		 404 aa  51.2  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.5 
 
 		 573 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  33.72 
 
 		 492 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.06 
 
 		 635 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  24.63 
 
 		 438 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  23.53 
 
 		 917 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4097  phosphoesterase  37.88 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  31.01 
 
 		 837 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  28.36 
 
 		 657 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1638 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  22.26 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.95 
 
 		 621 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  25.91 
 
 		 2698 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  25.97 
 
 		 663 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  25.59 
 
 		 1127 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.14 
 
 		 1236 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  28.52 
 
 		 1126 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  30.61 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  22.48 
 
 		 645 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1127 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3748  hypothetical protein  27.27 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.07 
 
 		 1225 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  29.7 
 
 		 491 aa  43.9  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.19 
 
 		 1226 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  20.96 
 
 		 1210 aa  43.5  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1628  hypothetical protein  29.59 
 
 		 612 aa  43.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  25.4 
 
 		 685 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>