16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1628 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1628  hypothetical protein  100 
 
 
612 aa  1246    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  59.67 
 
 
683 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  44.55 
 
 
1128 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6636  Pyrrolo-quinoline quinone  41.29 
 
 
577 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  39.77 
 
 
841 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  39.84 
 
 
574 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.254768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3192  hypothetical protein  40.94 
 
 
596 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105829  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0774  hypothetical protein  40.35 
 
 
586 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1154  hypothetical protein  35.25 
 
 
727 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00101932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  29.45 
 
 
1192 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  30.02 
 
 
1236 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0402  Pyrrolo-quinoline quinone  25.55 
 
 
531 aa  79.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8051  Pyrrolo-quinoline quinone  29.7 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.761196  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4181  phospholipase C  27.19 
 
 
522 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.508071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4097  phosphoesterase  30.49 
 
 
396 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  27.63 
 
 
492 aa  43.9  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>