13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1202 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0774  hypothetical protein  80.4 
 
 
586 aa  835    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
574 aa  1159    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.254768 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6636  Pyrrolo-quinoline quinone  62.48 
 
 
577 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3192  hypothetical protein  79.88 
 
 
596 aa  835    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105829  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  44.55 
 
 
1128 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  40.12 
 
 
841 aa  324  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1628  hypothetical protein  39.84 
 
 
612 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  41.06 
 
 
683 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1154  hypothetical protein  31.84 
 
 
727 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00101932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  30.65 
 
 
1236 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  29.29 
 
 
1192 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8051  Pyrrolo-quinoline quinone  25.47 
 
 
434 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.761196  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0402  Pyrrolo-quinoline quinone  25.37 
 
 
531 aa  55.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>