17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1154 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1154  hypothetical protein  100 
 
 
727 aa  1460    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00101932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  34.95 
 
 
841 aa  260  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1628  hypothetical protein  35.25 
 
 
612 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  34.23 
 
 
1128 aa  244  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  33.21 
 
 
683 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  32.22 
 
 
574 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.254768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3192  hypothetical protein  32.65 
 
 
596 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105829  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0774  hypothetical protein  32.03 
 
 
586 aa  211  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6636  Pyrrolo-quinoline quinone  32.16 
 
 
577 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  30.35 
 
 
1192 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  29.16 
 
 
1236 aa  177  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0402  Pyrrolo-quinoline quinone  28.83 
 
 
531 aa  104  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8051  Pyrrolo-quinoline quinone  27.19 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.761196  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  36.63 
 
 
1550 aa  51.2  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  33.33 
 
 
3563 aa  48.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.05 
 
 
1607 aa  47.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.63 
 
 
1292 aa  45.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>