42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1148 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  100 
 
 
683 aa  1374    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1628  hypothetical protein  59.67 
 
 
612 aa  598  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  40.82 
 
 
574 aa  332  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.254768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  37.13 
 
 
841 aa  331  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  40.85 
 
 
1128 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0774  hypothetical protein  40.78 
 
 
586 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6636  Pyrrolo-quinoline quinone  40.12 
 
 
577 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3192  hypothetical protein  39.65 
 
 
596 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105829  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1154  hypothetical protein  34.28 
 
 
727 aa  233  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00101932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  34.04 
 
 
1192 aa  184  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  31.26 
 
 
1236 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0402  Pyrrolo-quinoline quinone  26.07 
 
 
531 aa  77.8  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  45.33 
 
 
2961 aa  63.9  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8051  Pyrrolo-quinoline quinone  25.57 
 
 
434 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.761196  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 
1281 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.81 
 
 
752 aa  61.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  36.84 
 
 
572 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.21 
 
 
761 aa  58.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  39.76 
 
 
536 aa  58.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.75 
 
 
850 aa  57.4  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  43.59 
 
 
575 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  37.8 
 
 
2831 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.21 
 
 
994 aa  57  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  39.53 
 
 
575 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  37.36 
 
 
490 aa  54.3  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  41.56 
 
 
892 aa  53.9  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 
1316 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  37.08 
 
 
490 aa  52  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  35.16 
 
 
449 aa  51.2  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  25.48 
 
 
932 aa  51.6  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  30.43 
 
 
1361 aa  50.8  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  33.89 
 
 
905 aa  50.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  33.11 
 
 
799 aa  50.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  34.19 
 
 
1180 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3550  Ig domain protein group 2 domain protein  34.72 
 
 
436 aa  48.9  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2284  Ig-like, group 2  31.25 
 
 
201 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.1 
 
 
1776 aa  48.1  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  27.27 
 
 
466 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  34.29 
 
 
688 aa  45.8  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  38.46 
 
 
526 aa  45.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3061  hypothetical protein  47.44 
 
 
426 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.3596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0690  hypothetical protein  40.54 
 
 
144 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>