16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3061 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3061  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  824    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.3596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  31.4 
 
 
2961 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3197  hypothetical protein  29.18 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000483676  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  30.67 
 
 
2831 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  50.68 
 
 
443 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3195  OmpA/MotB domain-containing protein  36.73 
 
 
361 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.94 
 
 
850 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.94 
 
 
761 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.94 
 
 
994 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0535  hypothetical protein  38.16 
 
 
402 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.492189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 
333 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 
434 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0591  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.99 
 
 
241 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 
333 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0690  hypothetical protein  33.78 
 
 
144 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>