42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2898 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  89.04 
 
 
572 aa  858    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  100 
 
 
575 aa  1057    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  97.39 
 
 
575 aa  868    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  32.2 
 
 
1281 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  36.48 
 
 
892 aa  239  9e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  36.17 
 
 
1316 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  33.65 
 
 
799 aa  203  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.39 
 
 
752 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  31.49 
 
 
905 aa  187  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  30.68 
 
 
449 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  31.8 
 
 
466 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  33.46 
 
 
1180 aa  146  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  40 
 
 
526 aa  143  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2433  putative surface protein  30.59 
 
 
657 aa  116  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0842  putative surface protein  26.67 
 
 
649 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  27.77 
 
 
1361 aa  110  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.28 
 
 
1776 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  37.18 
 
 
316 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  28.54 
 
 
1279 aa  88.2  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  28.39 
 
 
1821 aa  75.5  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2284  Ig-like, group 2  36.81 
 
 
201 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  25.63 
 
 
1300 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  45.88 
 
 
490 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  46.07 
 
 
490 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  36.14 
 
 
1737 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  24.66 
 
 
4630 aa  54.3  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  43.84 
 
 
683 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0820  Ig domain-containing protein  42.67 
 
 
482 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  33.33 
 
 
536 aa  50.8  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  40.74 
 
 
924 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  34.57 
 
 
932 aa  47  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3550  Ig domain protein group 2 domain protein  28.97 
 
 
436 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  25.11 
 
 
2638 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  31.68 
 
 
1245 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  37.5 
 
 
2172 aa  45.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  29.56 
 
 
220 aa  45.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  27.4 
 
 
331 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  26.15 
 
 
472 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  26.15 
 
 
472 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  34.48 
 
 
688 aa  44.3  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  36.96 
 
 
867 aa  43.9  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.58 
 
 
12684 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>