18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0820 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0820  Ig domain-containing protein  100 
 
 
482 aa  996    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2495  hypothetical protein  41.81 
 
 
786 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300781 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  44.32 
 
 
905 aa  56.6  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  32.79 
 
 
932 aa  55.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2632  hypothetical protein  31.51 
 
 
1736 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  37.62 
 
 
575 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  35.64 
 
 
572 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3131  hypothetical protein  28.99 
 
 
1757 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  40 
 
 
575 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  35 
 
 
490 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  33.33 
 
 
526 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  41.33 
 
 
799 aa  47.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  32.5 
 
 
490 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.56 
 
 
752 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1832  hypothetical protein  34.62 
 
 
509 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  39.74 
 
 
688 aa  43.9  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  32.97 
 
 
466 aa  43.5  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0758  hypothetical protein  23.7 
 
 
497 aa  43.5  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.597673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>