18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0842 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0842  putative surface protein  100 
 
 		 649 aa  1327    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2433  putative surface protein  29.4 
 
 		 657 aa  241  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  25.92 
 
 		 1281 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  29.02 
 
 		 892 aa  98.6  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  25.67 
 
 		 572 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  27.9 
 
 		 799 aa  92.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  25.94 
 
 		 1316 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  25.9 
 
 		 575 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  24.88 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  26.14 
 
 		 575 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.41 
 
 		 752 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  24.45 
 
 		 905 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.63 
 
 		 1776 aa  62  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  23.84 
 
 		 1361 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  25.26 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  31.58 
 
 		 316 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  22.93 
 
 		 449 aa  51.6  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  26.65 
 
 		 1279 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>