67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2091 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  92.45 
 
 		 490 aa  865    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  100 
 
 		 490 aa  951    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1674  Gly/Ala/Ser-rich lipoprotein  47.23 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000593206  normal  0.738072 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4403  hypothetical protein  42.93 
 
 		 425 aa  253  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0722  hypothetical protein  40.77 
 
 		 420 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159827  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2807  hypothetical protein  41.73 
 
 		 432 aa  242  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101289  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2678  hypothetical protein  41.43 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2965  hypothetical protein  43.54 
 
 		 422 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772212 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1441  hypothetical protein  41.14 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595377  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0174  hypothetical protein  39.14 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436838  normal  0.203146 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5780  hypothetical protein  38.59 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5080  hypothetical protein  38.59 
 
 		 415 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1525  hypothetical protein  38.5 
 
 		 441 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3805  hypothetical protein  39.16 
 
 		 429 aa  213  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1723  putative lipoprotein  40.43 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0128  hypothetical protein  41.83 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0193  putative lipoprotein  39.78 
 
 		 400 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1527  hypothetical protein  39.78 
 
 		 400 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0973  putative lipoprotein  39.78 
 
 		 400 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1902  hypothetical protein  39.52 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2580  putative lipoprotein  39.62 
 
 		 402 aa  210  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0212468  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4398  hypothetical protein  38.2 
 
 		 415 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1746  putative lipoprotein  39.25 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68452  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4277  hypothetical protein  38.9 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.354093 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3126  putative lipoprotein  40.74 
 
 		 416 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3425  putative lipoprotein  40.74 
 
 		 416 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1693  putative lipoprotein  40.74 
 
 		 416 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2849  putative lipoprotein  40.74 
 
 		 416 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3846  putative lipoprotein  40.58 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3927  putative lipoprotein  40.32 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.358946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0066  putative lipoprotein  40.32 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0178  hypothetical protein  37.43 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4087  hypothetical protein  37.89 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0191  hypothetical protein  36.56 
 
 		 408 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2249  hypothetical protein  37.5 
 
 		 496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0535  hypothetical protein  37.4 
 
 		 436 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174398  normal  0.938705 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3173  putative lipoprotein  39.21 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0955  hypothetical protein  36.78 
 
 		 547 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1364  putative lipoprotein  36.64 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3367  hypothetical protein  35.95 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00722309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0247  hypothetical protein  36.19 
 
 		 414 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0265  hypothetical protein  35.64 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433715  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2842  hypothetical protein  35.64 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3682  hypothetical protein  35.41 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2051  hypothetical protein  32.86 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350134  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0957  hypothetical protein  33.51 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3680  hypothetical protein  32.54 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.13 
 
 		 752 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  44.76 
 
 		 526 aa  63.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  40.54 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  39.47 
 
 		 575 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  30.89 
 
 		 1281 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  40.82 
 
 		 575 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  42.7 
 
 		 1180 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  44.32 
 
 		 316 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  30.91 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  42.7 
 
 		 892 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  38.27 
 
 		 683 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  36.27 
 
 		 536 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.71 
 
 		 1776 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 449 aa  50.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  39.24 
 
 		 924 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3550  Ig domain protein group 2 domain protein  41.51 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  41.56 
 
 		 1245 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1430  Ig domain-containing protein  29.46 
 
 		 840 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0820  Ig domain-containing protein  32.5 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  37.97 
 
 		 1316 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>