47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4087 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4087  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  879    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0535  hypothetical protein  83.63 
 
 
436 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174398  normal  0.938705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4277  hypothetical protein  50.91 
 
 
423 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.354093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1525  hypothetical protein  39.82 
 
 
441 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2678  hypothetical protein  40.4 
 
 
427 aa  249  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1441  hypothetical protein  40.11 
 
 
350 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595377  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5780  hypothetical protein  42.44 
 
 
415 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0191  hypothetical protein  42.05 
 
 
408 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4398  hypothetical protein  41.87 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5080  hypothetical protein  42.18 
 
 
415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0174  hypothetical protein  43.35 
 
 
431 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436838  normal  0.203146 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1902  hypothetical protein  42.51 
 
 
402 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3805  hypothetical protein  41.45 
 
 
429 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1746  putative lipoprotein  42.25 
 
 
398 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1527  hypothetical protein  42.25 
 
 
400 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0973  putative lipoprotein  42.25 
 
 
400 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0193  putative lipoprotein  42.25 
 
 
400 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0178  hypothetical protein  42.25 
 
 
409 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0128  hypothetical protein  42.22 
 
 
431 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382199  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1723  putative lipoprotein  41.44 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3846  putative lipoprotein  41.82 
 
 
434 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3927  putative lipoprotein  41.82 
 
 
434 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.358946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0066  putative lipoprotein  41.82 
 
 
434 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3173  putative lipoprotein  43.12 
 
 
437 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2965  hypothetical protein  41.27 
 
 
422 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772212 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3682  hypothetical protein  39.68 
 
 
530 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0722  hypothetical protein  38.42 
 
 
420 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159827  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4403  hypothetical protein  40.21 
 
 
425 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0957  hypothetical protein  38.96 
 
 
443 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1693  putative lipoprotein  39.28 
 
 
416 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2849  putative lipoprotein  39.28 
 
 
416 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3425  putative lipoprotein  39.28 
 
 
416 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3126  putative lipoprotein  39.28 
 
 
416 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1674  Gly/Ala/Ser-rich lipoprotein  38.79 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000593206  normal  0.738072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2249  hypothetical protein  37.79 
 
 
496 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448065  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2807  hypothetical protein  40.36 
 
 
432 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101289  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3367  hypothetical protein  41.26 
 
 
413 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00722309  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0265  hypothetical protein  39.94 
 
 
416 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433715  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2842  hypothetical protein  39.94 
 
 
416 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0955  hypothetical protein  36.87 
 
 
547 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0247  hypothetical protein  39.94 
 
 
414 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3680  hypothetical protein  36.99 
 
 
453 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  37.89 
 
 
490 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  37.47 
 
 
490 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2580  putative lipoprotein  35.63 
 
 
402 aa  186  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0212468  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1364  putative lipoprotein  32.99 
 
 
421 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158439  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2051  hypothetical protein  33.62 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>