121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0955 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0955  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1065    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2249  hypothetical protein  44.98 
 
 		 496 aa  365  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0957  hypothetical protein  46.75 
 
 		 443 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3680  hypothetical protein  46.35 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1525  hypothetical protein  42.36 
 
 		 441 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2678  hypothetical protein  41.19 
 
 		 427 aa  247  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2580  putative lipoprotein  40.85 
 
 		 402 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0212468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1902  hypothetical protein  40.58 
 
 		 402 aa  246  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1746  putative lipoprotein  40.32 
 
 		 398 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1527  hypothetical protein  40.05 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0193  putative lipoprotein  40.05 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0973  putative lipoprotein  40.05 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1441  hypothetical protein  41.24 
 
 		 350 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595377  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1723  putative lipoprotein  39.26 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0722  hypothetical protein  37.94 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159827  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4403  hypothetical protein  38.56 
 
 		 425 aa  225  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0128  hypothetical protein  37.66 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4087  hypothetical protein  36.57 
 
 		 446 aa  210  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2807  hypothetical protein  36.78 
 
 		 432 aa  209  8e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101289  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0191  hypothetical protein  37.23 
 
 		 408 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0535  hypothetical protein  36.17 
 
 		 436 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174398  normal  0.938705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4277  hypothetical protein  35.92 
 
 		 423 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.354093 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5780  hypothetical protein  36.41 
 
 		 415 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3805  hypothetical protein  35.88 
 
 		 429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4398  hypothetical protein  35.88 
 
 		 415 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1674  Gly/Ala/Ser-rich lipoprotein  38.4 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000593206  normal  0.738072 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0174  hypothetical protein  36.07 
 
 		 431 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436838  normal  0.203146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5080  hypothetical protein  36.15 
 
 		 415 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0178  hypothetical protein  36.05 
 
 		 409 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2965  hypothetical protein  37.03 
 
 		 422 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772212 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2849  putative lipoprotein  36.81 
 
 		 416 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3425  putative lipoprotein  36.81 
 
 		 416 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1693  putative lipoprotein  36.81 
 
 		 416 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3126  putative lipoprotein  36.81 
 
 		 416 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3846  putative lipoprotein  37.08 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0066  putative lipoprotein  36.81 
 
 		 434 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3927  putative lipoprotein  36.81 
 
 		 434 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.358946  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0247  hypothetical protein  34.31 
 
 		 414 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  36.78 
 
 		 490 aa  173  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2842  hypothetical protein  34.3 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0265  hypothetical protein  34.3 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3173  putative lipoprotein  35.77 
 
 		 437 aa  170  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3367  hypothetical protein  34.38 
 
 		 413 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00722309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  35.07 
 
 		 490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1364  putative lipoprotein  32.55 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2051  hypothetical protein  33.06 
 
 		 345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  57.94 
 
 		 830 aa  87  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  47.01 
 
 		 916 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  46.96 
 
 		 2313 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  50.91 
 
 		 1394 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  49.17 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  45.28 
 
 		 551 aa  70.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  47.27 
 
 		 778 aa  70.5  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  60.56 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  41.41 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  44.55 
 
 		 555 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  42.06 
 
 		 617 aa  67.4  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  35.17 
 
 		 840 aa  67  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  47.06 
 
 		 268 aa  66.6  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  56.94 
 
 		 846 aa  64.7  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  33.83 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  35.71 
 
 		 2272 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  36.56 
 
 		 2179 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  43.33 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  37.82 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  52.73 
 
 		 625 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  60 
 
 		 1281 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  43.56 
 
 		 521 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  43.64 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  41.73 
 
 		 489 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  32.17 
 
 		 1000 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  61.29 
 
 		 771 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.44 
 
 		 257 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  55.93 
 
 		 914 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  32.26 
 
 		 489 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  56.47 
 
 		 605 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  38.46 
 
 		 259 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  30.48 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.35 
 
 		 261 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  51.33 
 
 		 2353 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  40 
 
 		 633 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  32.78 
 
 		 1028 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  38.96 
 
 		 667 aa  50.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  48.89 
 
 		 356 aa  50.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1728  hypothetical protein  39.84 
 
 		 639 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  30.92 
 
 		 456 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  36.91 
 
 		 1096 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  34.26 
 
 		 488 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48494  predicted protein  40 
 
 		 582 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  53.23 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  29.21 
 
 		 675 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.23 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  58.33 
 
 		 455 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  45.9 
 
 		 1217 aa  48.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48495  predicted protein  39.51 
 
 		 472 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  50 
 
 		 431 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2129  hypothetical protein  54.24 
 
 		 487 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  40.4 
 
 		 875 aa  47.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  48.53 
 
 		 449 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  58 
 
 		 673 aa  47  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>