47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2842 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0247  hypothetical protein  97.6 
 
 
414 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2842  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  823    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0265  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  823    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3367  hypothetical protein  83.93 
 
 
413 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00722309  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0174  hypothetical protein  70.51 
 
 
431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436838  normal  0.203146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0178  hypothetical protein  73.76 
 
 
409 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0191  hypothetical protein  70.21 
 
 
408 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4398  hypothetical protein  60.99 
 
 
415 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5780  hypothetical protein  61.47 
 
 
415 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5080  hypothetical protein  61.23 
 
 
415 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2849  putative lipoprotein  57.33 
 
 
416 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3425  putative lipoprotein  57.33 
 
 
416 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1693  putative lipoprotein  57.33 
 
 
416 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3126  putative lipoprotein  57.33 
 
 
416 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3846  putative lipoprotein  58.27 
 
 
434 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3927  putative lipoprotein  58.27 
 
 
434 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.358946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0066  putative lipoprotein  58.27 
 
 
434 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3173  putative lipoprotein  57.95 
 
 
437 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3805  hypothetical protein  48.12 
 
 
429 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2965  hypothetical protein  46.67 
 
 
422 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772212 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0128  hypothetical protein  47.73 
 
 
431 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382199  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4277  hypothetical protein  41.99 
 
 
423 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.354093 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1723  putative lipoprotein  38.79 
 
 
406 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1902  hypothetical protein  39.05 
 
 
402 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1746  putative lipoprotein  39.05 
 
 
398 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2580  putative lipoprotein  39.35 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0212468  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4087  hypothetical protein  41.01 
 
 
446 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1527  hypothetical protein  39.08 
 
 
400 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0193  putative lipoprotein  39.08 
 
 
400 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0973  putative lipoprotein  39.08 
 
 
400 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0722  hypothetical protein  38.48 
 
 
420 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159827  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1525  hypothetical protein  37.43 
 
 
441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1441  hypothetical protein  37.85 
 
 
350 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595377  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0535  hypothetical protein  39.58 
 
 
436 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174398  normal  0.938705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2678  hypothetical protein  36.78 
 
 
427 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4403  hypothetical protein  38.2 
 
 
425 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1674  Gly/Ala/Ser-rich lipoprotein  39.06 
 
 
417 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000593206  normal  0.738072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2249  hypothetical protein  35.75 
 
 
496 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448065  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0955  hypothetical protein  34.04 
 
 
547 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2807  hypothetical protein  34.99 
 
 
432 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1364  putative lipoprotein  34.13 
 
 
421 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158439  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  35.62 
 
 
490 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  35.62 
 
 
490 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3682  hypothetical protein  33.59 
 
 
530 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2051  hypothetical protein  32.09 
 
 
345 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350134  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0957  hypothetical protein  33.42 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3680  hypothetical protein  32.62 
 
 
453 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>