95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3682 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3682  hypothetical protein  100 
 
 		 530 aa  1032    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2249  hypothetical protein  53.12 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0957  hypothetical protein  48.26 
 
 		 443 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3680  hypothetical protein  48.96 
 
 		 453 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0535  hypothetical protein  39.19 
 
 		 436 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174398  normal  0.938705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4403  hypothetical protein  41 
 
 		 425 aa  233  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4087  hypothetical protein  38.71 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0722  hypothetical protein  39.9 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159827  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4277  hypothetical protein  38.56 
 
 		 423 aa  231  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.354093 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1902  hypothetical protein  40.53 
 
 		 402 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1746  putative lipoprotein  40.53 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1527  hypothetical protein  40.26 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0973  putative lipoprotein  40.26 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0193  putative lipoprotein  40.26 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2580  putative lipoprotein  40.79 
 
 		 402 aa  223  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0212468  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1723  putative lipoprotein  40.26 
 
 		 406 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0128  hypothetical protein  39.54 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1525  hypothetical protein  39.11 
 
 		 441 aa  211  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2807  hypothetical protein  37.68 
 
 		 432 aa  209  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101289  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2678  hypothetical protein  39.41 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1441  hypothetical protein  40.22 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595377  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3805  hypothetical protein  38.01 
 
 		 429 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0178  hypothetical protein  35.88 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0191  hypothetical protein  37.3 
 
 		 408 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0174  hypothetical protein  35.71 
 
 		 431 aa  191  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436838  normal  0.203146 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5780  hypothetical protein  34.97 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2965  hypothetical protein  37.4 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772212 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4398  hypothetical protein  34.72 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5080  hypothetical protein  34.72 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1674  Gly/Ala/Ser-rich lipoprotein  35.35 
 
 		 417 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000593206  normal  0.738072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1364  putative lipoprotein  32.93 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3126  putative lipoprotein  34.65 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3425  putative lipoprotein  34.65 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2849  putative lipoprotein  34.65 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1693  putative lipoprotein  34.65 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3846  putative lipoprotein  34.91 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3927  putative lipoprotein  34.91 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.358946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0066  putative lipoprotein  34.91 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2051  hypothetical protein  33.91 
 
 		 345 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350134  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3173  putative lipoprotein  34.97 
 
 		 437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  35.68 
 
 		 490 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  35.41 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0247  hypothetical protein  33.51 
 
 		 414 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2842  hypothetical protein  33.16 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0265  hypothetical protein  33.16 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3367  hypothetical protein  33.42 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00722309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  43.09 
 
 		 2313 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  45.28 
 
 		 830 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  40.71 
 
 		 778 aa  64.3  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  47.73 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  36.64 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  46.07 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  32.62 
 
 		 840 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  50 
 
 		 625 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  47.3 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  36.13 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  35.9 
 
 		 916 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  55.7 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  41.07 
 
 		 671 aa  57.4  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2404  FHA domain-containing protein  40.15 
 
 		 489 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210357  hitchhiker  0.0000326037 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  29.2 
 
 		 489 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  49.09 
 
 		 1281 aa  54.7  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.5 
 
 		 261 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  37.75 
 
 		 522 aa  53.5  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  28.83 
 
 		 484 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  36.59 
 
 		 555 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  43.27 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  38.02 
 
 		 1000 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  45.69 
 
 		 605 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  39.36 
 
 		 1567 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  40 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  37.86 
 
 		 1394 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  32.24 
 
 		 572 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  40.32 
 
 		 687 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  38.27 
 
 		 846 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30179  hypothetical protein  33.66 
 
 		 617 aa  48.5  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  46.88 
 
 		 449 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.29 
 
 		 1162 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  48.39 
 
 		 771 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  43.48 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  35.43 
 
 		 2353 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  32.56 
 
 		 259 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  33.56 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50210  predicted protein  36.73 
 
 		 521 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722754  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  33.07 
 
 		 1461 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  37.1 
 
 		 1217 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  30 
 
 		 431 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  41.43 
 
 		 445 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48553  predicted protein  36.21 
 
 		 952 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.102709  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  46.25 
 
 		 356 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2777  hypothetical protein  42.06 
 
 		 428 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  39.29 
 
 		 467 aa  43.9  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48492  predicted protein  32.94 
 
 		 488 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439098  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45586  predicted protein  42.86 
 
 		 706 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  30.6 
 
 		 667 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>