47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0178 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0191  hypothetical protein  83.94 
 
 		 408 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0174  hypothetical protein  78.19 
 
 		 431 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436838  normal  0.203146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0178  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0247  hypothetical protein  72.21 
 
 		 414 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0265  hypothetical protein  71.63 
 
 		 416 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433715  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2842  hypothetical protein  71.63 
 
 		 416 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3367  hypothetical protein  74.76 
 
 		 413 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00722309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5780  hypothetical protein  63.92 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4398  hypothetical protein  62.71 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5080  hypothetical protein  63.68 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0066  putative lipoprotein  62.7 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3126  putative lipoprotein  60.76 
 
 		 416 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3927  putative lipoprotein  62.7 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.358946  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3846  putative lipoprotein  62.7 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1693  putative lipoprotein  60.76 
 
 		 416 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3425  putative lipoprotein  60.76 
 
 		 416 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2849  putative lipoprotein  60.76 
 
 		 416 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3173  putative lipoprotein  61.62 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3805  hypothetical protein  52.85 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0128  hypothetical protein  53.1 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2965  hypothetical protein  51.12 
 
 		 422 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772212 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4277  hypothetical protein  45 
 
 		 423 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.354093 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2580  putative lipoprotein  40.86 
 
 		 402 aa  260  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0212468  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0722  hypothetical protein  43.58 
 
 		 420 aa  255  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159827  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4403  hypothetical protein  43.58 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1723  putative lipoprotein  40 
 
 		 406 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1746  putative lipoprotein  40 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68452  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1902  hypothetical protein  40 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0973  putative lipoprotein  40.05 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0193  putative lipoprotein  40.05 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1527  hypothetical protein  40.05 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306646  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1525  hypothetical protein  37.67 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1441  hypothetical protein  40.79 
 
 		 350 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595377  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4087  hypothetical protein  42.11 
 
 		 446 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2678  hypothetical protein  38.12 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0535  hypothetical protein  41.71 
 
 		 436 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174398  normal  0.938705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2807  hypothetical protein  38.68 
 
 		 432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1674  Gly/Ala/Ser-rich lipoprotein  40 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000593206  normal  0.738072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  37.4 
 
 		 490 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2249  hypothetical protein  35.82 
 
 		 496 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  37.73 
 
 		 490 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3682  hypothetical protein  35.98 
 
 		 530 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0955  hypothetical protein  35.19 
 
 		 547 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1364  putative lipoprotein  36.24 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0957  hypothetical protein  35.26 
 
 		 443 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2051  hypothetical protein  33.81 
 
 		 345 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350134  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3680  hypothetical protein  36.23 
 
 		 453 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>