47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0128 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3805  hypothetical protein  82.37 
 
 
429 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0128  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  846    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382199  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2965  hypothetical protein  57.85 
 
 
422 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0174  hypothetical protein  53.21 
 
 
431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436838  normal  0.203146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0178  hypothetical protein  53.1 
 
 
409 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0191  hypothetical protein  53.1 
 
 
408 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5780  hypothetical protein  47.67 
 
 
415 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5080  hypothetical protein  47.67 
 
 
415 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4398  hypothetical protein  46.68 
 
 
415 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3173  putative lipoprotein  51.59 
 
 
437 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0066  putative lipoprotein  52.77 
 
 
434 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3927  putative lipoprotein  52.77 
 
 
434 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.358946  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3846  putative lipoprotein  52.77 
 
 
434 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3367  hypothetical protein  50.4 
 
 
413 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00722309  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3126  putative lipoprotein  52.51 
 
 
416 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2849  putative lipoprotein  52.51 
 
 
416 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3425  putative lipoprotein  52.51 
 
 
416 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1693  putative lipoprotein  52.51 
 
 
416 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0247  hypothetical protein  48.38 
 
 
414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2842  hypothetical protein  47.85 
 
 
416 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0265  hypothetical protein  47.85 
 
 
416 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433715  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4277  hypothetical protein  44.9 
 
 
423 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.354093 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4087  hypothetical protein  44.33 
 
 
446 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1525  hypothetical protein  41.61 
 
 
441 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151714 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2580  putative lipoprotein  44.65 
 
 
402 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0212468  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0535  hypothetical protein  43.9 
 
 
436 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174398  normal  0.938705 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1902  hypothetical protein  44.68 
 
 
402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1723  putative lipoprotein  44.41 
 
 
406 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1527  hypothetical protein  44.41 
 
 
400 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0193  putative lipoprotein  44.41 
 
 
400 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1746  putative lipoprotein  44.41 
 
 
398 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0973  putative lipoprotein  44.41 
 
 
400 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2807  hypothetical protein  41.65 
 
 
432 aa  256  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101289  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1441  hypothetical protein  42.42 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595377  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2678  hypothetical protein  41.15 
 
 
427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4403  hypothetical protein  42.78 
 
 
425 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2249  hypothetical protein  41.3 
 
 
496 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448065  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0722  hypothetical protein  41.56 
 
 
420 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159827  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3682  hypothetical protein  39.63 
 
 
530 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  39.09 
 
 
490 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0955  hypothetical protein  37.96 
 
 
547 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1674  Gly/Ala/Ser-rich lipoprotein  41.43 
 
 
417 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000593206  normal  0.738072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  39.32 
 
 
490 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1364  putative lipoprotein  39.35 
 
 
421 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158439  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0957  hypothetical protein  37.79 
 
 
443 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2051  hypothetical protein  36.57 
 
 
345 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350134  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3680  hypothetical protein  33.91 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>