47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0191 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0191  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  809    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0178  hypothetical protein  83.94 
 
 
409 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0174  hypothetical protein  73.84 
 
 
431 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436838  normal  0.203146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0247  hypothetical protein  68.65 
 
 
414 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3367  hypothetical protein  72.62 
 
 
413 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00722309  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0265  hypothetical protein  67.85 
 
 
416 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433715  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2842  hypothetical protein  67.85 
 
 
416 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5780  hypothetical protein  61.65 
 
 
415 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5080  hypothetical protein  61.65 
 
 
415 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4398  hypothetical protein  60.44 
 
 
415 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0066  putative lipoprotein  61.52 
 
 
434 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3126  putative lipoprotein  59.95 
 
 
416 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3927  putative lipoprotein  61.52 
 
 
434 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.358946  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3846  putative lipoprotein  61.52 
 
 
434 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1693  putative lipoprotein  59.95 
 
 
416 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3425  putative lipoprotein  59.95 
 
 
416 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2849  putative lipoprotein  59.95 
 
 
416 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3173  putative lipoprotein  61.52 
 
 
437 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3805  hypothetical protein  53.66 
 
 
429 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0128  hypothetical protein  53.1 
 
 
431 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382199  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2965  hypothetical protein  51.12 
 
 
422 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772212 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4277  hypothetical protein  45.21 
 
 
423 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.354093 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2580  putative lipoprotein  42.59 
 
 
402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0212468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1902  hypothetical protein  41.44 
 
 
402 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1746  putative lipoprotein  41.18 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1527  hypothetical protein  41.24 
 
 
400 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0193  putative lipoprotein  41.24 
 
 
400 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0973  putative lipoprotein  41.24 
 
 
400 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1723  putative lipoprotein  40.91 
 
 
406 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4087  hypothetical protein  42.05 
 
 
446 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1525  hypothetical protein  37.76 
 
 
441 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151714 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0722  hypothetical protein  41.98 
 
 
420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159827  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4403  hypothetical protein  42.86 
 
 
425 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1441  hypothetical protein  38.89 
 
 
350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595377  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0535  hypothetical protein  41.07 
 
 
436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174398  normal  0.938705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2678  hypothetical protein  37.83 
 
 
427 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2807  hypothetical protein  38.26 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1674  Gly/Ala/Ser-rich lipoprotein  40.88 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000593206  normal  0.738072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2249  hypothetical protein  37.84 
 
 
496 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448065  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0955  hypothetical protein  37.6 
 
 
547 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3682  hypothetical protein  37.14 
 
 
530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1364  putative lipoprotein  38.26 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158439  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  36.53 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  36.7 
 
 
490 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0957  hypothetical protein  35.52 
 
 
443 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3680  hypothetical protein  36.86 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2051  hypothetical protein  34.62 
 
 
345 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>