72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2127 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  92.45 
 
 
490 aa  848    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  100 
 
 
490 aa  953    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1674  Gly/Ala/Ser-rich lipoprotein  46.17 
 
 
417 aa  310  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000593206  normal  0.738072 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4403  hypothetical protein  41.6 
 
 
425 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0722  hypothetical protein  39.74 
 
 
420 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159827  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2807  hypothetical protein  41.73 
 
 
432 aa  239  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101289  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2965  hypothetical protein  43.26 
 
 
422 aa  225  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0174  hypothetical protein  38.87 
 
 
431 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436838  normal  0.203146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2678  hypothetical protein  39.94 
 
 
427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1441  hypothetical protein  39.71 
 
 
350 aa  217  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595377  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5780  hypothetical protein  35.77 
 
 
415 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5080  hypothetical protein  35.77 
 
 
415 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4398  hypothetical protein  35.52 
 
 
415 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1525  hypothetical protein  37.11 
 
 
441 aa  206  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151714 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0178  hypothetical protein  37.43 
 
 
409 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0973  putative lipoprotein  39.35 
 
 
400 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1527  hypothetical protein  39.35 
 
 
400 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0193  putative lipoprotein  39.35 
 
 
400 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227019  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0128  hypothetical protein  40.17 
 
 
431 aa  203  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382199  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3805  hypothetical protein  37.34 
 
 
429 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0191  hypothetical protein  36.56 
 
 
408 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1902  hypothetical protein  39.08 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1746  putative lipoprotein  38.81 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1723  putative lipoprotein  38.81 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1693  putative lipoprotein  38.62 
 
 
416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3126  putative lipoprotein  38.62 
 
 
416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2849  putative lipoprotein  38.62 
 
 
416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3425  putative lipoprotein  38.62 
 
 
416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3846  putative lipoprotein  38.46 
 
 
434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2580  putative lipoprotein  38.27 
 
 
402 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0212468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0066  putative lipoprotein  38.2 
 
 
434 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3927  putative lipoprotein  38.2 
 
 
434 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.358946  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4277  hypothetical protein  38.36 
 
 
423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.354093 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4087  hypothetical protein  37.47 
 
 
446 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0535  hypothetical protein  37.93 
 
 
436 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174398  normal  0.938705 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3173  putative lipoprotein  37.89 
 
 
437 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2249  hypothetical protein  35.7 
 
 
496 aa  186  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448065  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3367  hypothetical protein  35.77 
 
 
413 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00722309  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0247  hypothetical protein  35.64 
 
 
414 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0265  hypothetical protein  35.36 
 
 
416 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433715  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2842  hypothetical protein  35.36 
 
 
416 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1364  putative lipoprotein  35.36 
 
 
421 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158439  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0955  hypothetical protein  35.07 
 
 
547 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3682  hypothetical protein  35.68 
 
 
530 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2051  hypothetical protein  32.29 
 
 
345 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350134  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0957  hypothetical protein  31.61 
 
 
443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3680  hypothetical protein  31.1 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  48.81 
 
 
752 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  40.34 
 
 
526 aa  63.5  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  40.54 
 
 
572 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  46.59 
 
 
316 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  30.89 
 
 
1281 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  38.6 
 
 
575 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  42.7 
 
 
1180 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  38.24 
 
 
536 aa  57  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  40.82 
 
 
575 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  42.7 
 
 
892 aa  55.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  34.52 
 
 
449 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  38.27 
 
 
683 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  41.38 
 
 
688 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  29.91 
 
 
466 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3550  Ig domain protein group 2 domain protein  43.4 
 
 
436 aa  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0820  Ig domain-containing protein  35 
 
 
482 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  39.24 
 
 
924 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1430  Ig domain-containing protein  30.91 
 
 
840 aa  47.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  46.15 
 
 
905 aa  47.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  41.89 
 
 
799 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  41.56 
 
 
1245 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  33.72 
 
 
932 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  39.24 
 
 
1316 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  38.38 
 
 
1164 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  31.82 
 
 
1737 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>