47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5080 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4398  hypothetical protein  96.63 
 
 
415 aa  805    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5780  hypothetical protein  99.76 
 
 
415 aa  831    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5080  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  835    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0174  hypothetical protein  62.04 
 
 
431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436838  normal  0.203146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0178  hypothetical protein  66.67 
 
 
409 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0191  hypothetical protein  60.68 
 
 
408 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0247  hypothetical protein  59.38 
 
 
414 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0265  hypothetical protein  58.63 
 
 
416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433715  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2842  hypothetical protein  58.63 
 
 
416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3367  hypothetical protein  62.74 
 
 
413 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00722309  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0066  putative lipoprotein  58.97 
 
 
434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3126  putative lipoprotein  58.97 
 
 
416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3927  putative lipoprotein  58.97 
 
 
434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.358946  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3846  putative lipoprotein  58.7 
 
 
434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1693  putative lipoprotein  58.97 
 
 
416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3425  putative lipoprotein  58.97 
 
 
416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2849  putative lipoprotein  58.97 
 
 
416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3173  putative lipoprotein  57.88 
 
 
437 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3805  hypothetical protein  50.41 
 
 
429 aa  339  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2965  hypothetical protein  49.17 
 
 
422 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772212 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0128  hypothetical protein  49.46 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382199  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2580  putative lipoprotein  40.33 
 
 
402 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0212468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1902  hypothetical protein  39.73 
 
 
402 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1723  putative lipoprotein  39.2 
 
 
406 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4277  hypothetical protein  41.53 
 
 
423 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.354093 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4403  hypothetical protein  38.86 
 
 
425 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1746  putative lipoprotein  39.2 
 
 
398 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.68452  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0722  hypothetical protein  38.21 
 
 
420 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159827  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0973  putative lipoprotein  39.84 
 
 
400 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1527  hypothetical protein  39.84 
 
 
400 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0193  putative lipoprotein  39.84 
 
 
400 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227019  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4087  hypothetical protein  42.18 
 
 
446 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1525  hypothetical protein  39.89 
 
 
441 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1441  hypothetical protein  37.85 
 
 
350 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595377  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0535  hypothetical protein  40.8 
 
 
436 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174398  normal  0.938705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2678  hypothetical protein  37.11 
 
 
427 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2807  hypothetical protein  37.85 
 
 
432 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2091  Ig domain protein group 2 domain protein  38.59 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2127  Ig domain protein group 2 domain protein  35.77 
 
 
490 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0204814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1674  Gly/Ala/Ser-rich lipoprotein  38.74 
 
 
417 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000593206  normal  0.738072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0955  hypothetical protein  36.27 
 
 
547 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2249  hypothetical protein  34.68 
 
 
496 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448065  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3682  hypothetical protein  34.38 
 
 
530 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1364  putative lipoprotein  34.92 
 
 
421 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158439  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2051  hypothetical protein  34.1 
 
 
345 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350134  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0957  hypothetical protein  32.97 
 
 
443 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3680  hypothetical protein  32.56 
 
 
453 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>