120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1882 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  84.41 
 
 		 566 aa  853    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  100 
 
 		 573 aa  1147    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  27.87 
 
 		 1129 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.93 
 
 		 1236 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.74 
 
 		 1114 aa  154  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  25.72 
 
 		 1109 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.05 
 
 		 1225 aa  151  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  28.1 
 
 		 1208 aa  150  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.12 
 
 		 1228 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.05 
 
 		 1170 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  26.18 
 
 		 1088 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.33 
 
 		 1246 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.18 
 
 		 1226 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  28.1 
 
 		 1127 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.73 
 
 		 1192 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  29.39 
 
 		 1120 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  28.85 
 
 		 1098 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.89 
 
 		 1208 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  27.13 
 
 		 1113 aa  131  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.24 
 
 		 1189 aa  131  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  28.32 
 
 		 1203 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  27.11 
 
 		 1098 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  25.71 
 
 		 1183 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.42 
 
 		 1193 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  26.95 
 
 		 1126 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  24.82 
 
 		 1107 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.56 
 
 		 574 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.03 
 
 		 546 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  25.18 
 
 		 1172 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.32 
 
 		 1066 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.72 
 
 		 1040 aa  107  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  23.73 
 
 		 593 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  24.59 
 
 		 1166 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  24.5 
 
 		 649 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  28.3 
 
 		 604 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  25.74 
 
 		 593 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  25.18 
 
 		 573 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.54 
 
 		 600 aa  100  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  24.82 
 
 		 556 aa  98.6  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.54 
 
 		 551 aa  94.4  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  24.94 
 
 		 585 aa  94  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  25.4 
 
 		 569 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  26.33 
 
 		 521 aa  89  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.31 
 
 		 596 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  24.03 
 
 		 583 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.23 
 
 		 554 aa  84  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  27.4 
 
 		 1161 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  25.05 
 
 		 577 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  23.57 
 
 		 951 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  24.1 
 
 		 604 aa  77.8  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  34.55 
 
 		 492 aa  76.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.12 
 
 		 803 aa  76.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  28.26 
 
 		 657 aa  74.3  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.91 
 
 		 3197 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  24.88 
 
 		 668 aa  68.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.99 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  24.5 
 
 		 1838 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.76 
 
 		 1275 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  21.18 
 
 		 655 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.4 
 
 		 3197 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  24.08 
 
 		 872 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.79 
 
 		 737 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  27.79 
 
 		 1557 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  27.49 
 
 		 404 aa  62  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  23.72 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  26.3 
 
 		 562 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.57 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  28 
 
 		 616 aa  60.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.38 
 
 		 655 aa  60.1  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.3 
 
 		 1019 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.41 
 
 		 8871 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1575 aa  57.4  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.49 
 
 		 691 aa  57  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  26.47 
 
 		 664 aa  57  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  22.13 
 
 		 658 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  30.69 
 
 		 878 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  25.13 
 
 		 389 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  29.53 
 
 		 574 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.99 
 
 		 2194 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.3 
 
 		 638 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  26.84 
 
 		 406 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  24.21 
 
 		 1490 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  27.27 
 
 		 485 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.03 
 
 		 453 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.73 
 
 		 1113 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  22.35 
 
 		 655 aa  53.9  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 1127 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.66 
 
 		 1225 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  24.42 
 
 		 2807 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  28.51 
 
 		 386 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  28.18 
 
 		 828 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  27.23 
 
 		 1126 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.65 
 
 		 585 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  31 
 
 		 1527 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  23.97 
 
 		 730 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.08 
 
 		 1222 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  20.88 
 
 		 645 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  24.8 
 
 		 758 aa  50.4  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1289 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  23.49 
 
 		 646 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>