103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2997 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  100 
 
 
585 aa  1191    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  27.79 
 
 
1183 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  29.12 
 
 
1109 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  29.17 
 
 
1098 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  29.27 
 
 
593 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  28.09 
 
 
1129 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.8 
 
 
596 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  26.97 
 
 
1120 aa  146  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  27.34 
 
 
593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  27.76 
 
 
1166 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  28.62 
 
 
573 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.62 
 
 
600 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  27.1 
 
 
1127 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  25.96 
 
 
1203 aa  137  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  26.57 
 
 
1113 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.28 
 
 
1114 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  27.15 
 
 
562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  24.63 
 
 
1126 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  25.42 
 
 
1208 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.89 
 
 
1208 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  26.65 
 
 
649 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  28.24 
 
 
803 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  25.15 
 
 
1172 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  26.54 
 
 
604 aa  128  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.53 
 
 
1226 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.99 
 
 
1066 aa  127  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.88 
 
 
1236 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.27 
 
 
574 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.73 
 
 
1225 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.26 
 
 
1246 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.21 
 
 
546 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  25.17 
 
 
1161 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  28.9 
 
 
1575 aa  123  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.35 
 
 
1192 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.02 
 
 
1170 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.97 
 
 
551 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 
1189 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  25.92 
 
 
577 aa  122  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  29.16 
 
 
569 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  24.46 
 
 
1088 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.11 
 
 
574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  25.89 
 
 
1107 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  26.29 
 
 
1098 aa  117  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  23.71 
 
 
556 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.84 
 
 
737 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.2 
 
 
1193 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.82 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  25.92 
 
 
951 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 
1127 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  26.75 
 
 
604 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.44 
 
 
1228 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.43 
 
 
585 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  26.2 
 
 
583 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.99 
 
 
691 aa  90.9  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  30.67 
 
 
499 aa  87.8  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.52 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  24.77 
 
 
521 aa  84  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  25.88 
 
 
655 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.82 
 
 
526 aa  77.4  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  22.16 
 
 
681 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  25.89 
 
 
566 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  27.54 
 
 
878 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.47 
 
 
1040 aa  71.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  33.2 
 
 
8871 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.97 
 
 
455 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.82 
 
 
645 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25 
 
 
573 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  27.64 
 
 
768 aa  66.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  26.56 
 
 
482 aa  64.3  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.62 
 
 
668 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  22.45 
 
 
655 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  27.96 
 
 
645 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.22 
 
 
655 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.75 
 
 
638 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.79 
 
 
1557 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  24.16 
 
 
492 aa  56.6  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23 
 
 
657 aa  55.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  23.87 
 
 
658 aa  54.3  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  26.29 
 
 
590 aa  54.3  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  27.38 
 
 
752 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25.88 
 
 
447 aa  52  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  27.88 
 
 
566 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  32.86 
 
 
758 aa  51.2  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  28.31 
 
 
685 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  22.34 
 
 
667 aa  50.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26.69 
 
 
1275 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  27.13 
 
 
604 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  26.01 
 
 
685 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.09 
 
 
1838 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.95 
 
 
616 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  38.64 
 
 
664 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  35.53 
 
 
1133 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  26.85 
 
 
472 aa  47.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  23.66 
 
 
974 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.41 
 
 
677 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.9 
 
 
11716 aa  44.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.94 
 
 
437 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
1184 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  24.22 
 
 
646 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  28.37 
 
 
1348 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>