113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3076 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  43.19 
 
 
1161 aa  855    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  41.64 
 
 
1113 aa  768    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  36.86 
 
 
1208 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 
1107 aa  2279    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  43.02 
 
 
1166 aa  852    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  39.54 
 
 
1127 aa  716    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  37.64 
 
 
1183 aa  667    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  38.35 
 
 
1098 aa  667    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  40.99 
 
 
1109 aa  754    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  39.95 
 
 
1098 aa  743    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  44.68 
 
 
1120 aa  882    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  39.85 
 
 
1088 aa  714    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  38.36 
 
 
1129 aa  699    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  38.01 
 
 
1126 aa  676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  37.28 
 
 
1172 aa  630  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  34.91 
 
 
1203 aa  616  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.18 
 
 
1114 aa  518  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.81 
 
 
1236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.71 
 
 
1246 aa  461  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.04 
 
 
1208 aa  459  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.3 
 
 
1228 aa  456  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.39 
 
 
1170 aa  456  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.32 
 
 
1193 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.02 
 
 
1226 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.68 
 
 
1192 aa  422  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.99 
 
 
1189 aa  409  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.25 
 
 
1225 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  29.36 
 
 
556 aa  183  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  29.49 
 
 
573 aa  180  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.76 
 
 
596 aa  169  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  29.34 
 
 
649 aa  168  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.07 
 
 
1066 aa  160  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  28.3 
 
 
569 aa  159  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  28.99 
 
 
593 aa  159  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  26.64 
 
 
593 aa  159  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.8 
 
 
574 aa  159  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  27.39 
 
 
604 aa  155  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.08 
 
 
546 aa  148  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  28.41 
 
 
562 aa  142  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  25.53 
 
 
577 aa  141  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.52 
 
 
600 aa  138  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  26.77 
 
 
585 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  26.98 
 
 
583 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  24.47 
 
 
604 aa  120  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.33 
 
 
551 aa  116  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  26.65 
 
 
566 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.57 
 
 
737 aa  115  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.66 
 
 
574 aa  114  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.3 
 
 
803 aa  113  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  22.95 
 
 
521 aa  107  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  25.97 
 
 
951 aa  105  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
1127 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.09 
 
 
573 aa  98.2  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.21 
 
 
1040 aa  97.8  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  22.75 
 
 
492 aa  90.1  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.99 
 
 
638 aa  88.2  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  22.77 
 
 
668 aa  84  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.57 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  23.74 
 
 
1575 aa  80.9  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.93 
 
 
657 aa  79.7  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.33 
 
 
645 aa  79.7  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  22.25 
 
 
655 aa  77.4  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.64 
 
 
655 aa  75.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  27.2 
 
 
691 aa  75.5  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  22.33 
 
 
655 aa  72.8  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  42.86 
 
 
585 aa  69.7  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  25.23 
 
 
657 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  22.41 
 
 
658 aa  68.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.77 
 
 
526 aa  63.9  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  27.66 
 
 
1557 aa  63.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.14 
 
 
677 aa  62.4  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  25.59 
 
 
499 aa  61.6  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  24.63 
 
 
667 aa  61.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  22.99 
 
 
730 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  39.36 
 
 
878 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  30.8 
 
 
566 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  23.82 
 
 
681 aa  59.7  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.9 
 
 
453 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
1184 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  28.02 
 
 
590 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  25 
 
 
664 aa  57.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.42 
 
 
2807 aa  55.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  27.07 
 
 
506 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  21.88 
 
 
620 aa  53.5  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  31.5 
 
 
646 aa  52.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.79 
 
 
1118 aa  52.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.51 
 
 
1340 aa  52.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25.3 
 
 
447 aa  52  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  23.87 
 
 
1490 aa  51.6  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  27.5 
 
 
974 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  26.01 
 
 
510 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  23.02 
 
 
1124 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5796  hypothetical protein  26.16 
 
 
521 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243702  normal  0.17082 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  25.77 
 
 
1289 aa  48.9  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  29.31 
 
 
554 aa  48.9  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  25.96 
 
 
1126 aa  48.9  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  32.56 
 
 
616 aa  48.5  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.11 
 
 
1222 aa  48.1  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  27.59 
 
 
472 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  25.52 
 
 
813 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>