85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4587 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 
878 aa  1776    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  24.79 
 
 
646 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  26.93 
 
 
645 aa  108  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  33.5 
 
 
1575 aa  101  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  42.86 
 
 
551 aa  94.4  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  33.91 
 
 
556 aa  94  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.52 
 
 
546 aa  92.8  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  34.83 
 
 
573 aa  93.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  25.63 
 
 
1208 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.51 
 
 
574 aa  87.4  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  32.63 
 
 
655 aa  85.5  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  24.69 
 
 
574 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  25.62 
 
 
752 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  24.55 
 
 
664 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.26 
 
 
453 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  23.5 
 
 
1127 aa  82.8  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  29.67 
 
 
803 aa  80.1  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  27.02 
 
 
585 aa  80.1  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.11 
 
 
455 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
1127 aa  78.2  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  24.62 
 
 
593 aa  75.1  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.08 
 
 
1189 aa  74.7  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.98 
 
 
1236 aa  74.3  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  21.93 
 
 
1088 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.69 
 
 
1170 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.57 
 
 
1114 aa  72.8  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  26.85 
 
 
593 aa  72  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  27.7 
 
 
604 aa  70.9  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  36.36 
 
 
681 aa  71.2  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.95 
 
 
1246 aa  70.1  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  28.44 
 
 
1098 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  26.75 
 
 
569 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  32.04 
 
 
1183 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  29.65 
 
 
604 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  33.66 
 
 
1172 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  26.39 
 
 
1109 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  32.46 
 
 
562 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.11 
 
 
1228 aa  66.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  33.11 
 
 
583 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.36 
 
 
596 aa  65.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  28.97 
 
 
649 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.61 
 
 
737 aa  64.7  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.14 
 
 
1193 aa  64.7  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.88 
 
 
1208 aa  64.3  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  35.64 
 
 
685 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  26.38 
 
 
577 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  35.64 
 
 
685 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.18 
 
 
600 aa  63.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.22 
 
 
585 aa  63.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  29.65 
 
 
521 aa  62  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.37 
 
 
1225 aa  61.6  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  26.67 
 
 
1120 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  39.36 
 
 
1107 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  29 
 
 
482 aa  60.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  31.4 
 
 
1166 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  32.05 
 
 
1129 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  32.82 
 
 
1161 aa  58.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  30.82 
 
 
1203 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  23.06 
 
 
566 aa  57.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  26.4 
 
 
1126 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.91 
 
 
1226 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.14 
 
 
1192 aa  57  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.9 
 
 
526 aa  56.2  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.91 
 
 
2807 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.69 
 
 
1490 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  30.71 
 
 
1113 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  27.97 
 
 
813 aa  51.2  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.97 
 
 
1118 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  29.15 
 
 
566 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  45.33 
 
 
691 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  27.62 
 
 
1557 aa  50.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  31.34 
 
 
499 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.57 
 
 
1066 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.49 
 
 
1040 aa  49.7  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 
1184 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.83 
 
 
889 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  27.34 
 
 
974 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  36.21 
 
 
554 aa  47  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.39 
 
 
1340 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.71 
 
 
573 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  28.97 
 
 
604 aa  45.8  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  31.9 
 
 
951 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.79 
 
 
1275 aa  45.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  28.89 
 
 
8871 aa  44.7  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  24.43 
 
 
492 aa  44.7  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>