75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1255 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  100 
 
 
566 aa  1112    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  43.74 
 
 
590 aa  362  8e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  27.73 
 
 
573 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  24.02 
 
 
1088 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 
1127 aa  75.1  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  24.06 
 
 
1127 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  24.47 
 
 
604 aa  72  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  27.32 
 
 
569 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  30.72 
 
 
1098 aa  71.6  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  29.52 
 
 
803 aa  70.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  25.54 
 
 
593 aa  67.8  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.48 
 
 
546 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  22.99 
 
 
1113 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  27.68 
 
 
577 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  24.21 
 
 
562 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  23.22 
 
 
1109 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  25.16 
 
 
1098 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  24.7 
 
 
556 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  23.7 
 
 
1183 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.07 
 
 
1208 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.53 
 
 
585 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  25.06 
 
 
1203 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.02 
 
 
1236 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.28 
 
 
1193 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  31.08 
 
 
583 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  27.66 
 
 
604 aa  57.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.01 
 
 
2807 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  23.06 
 
 
878 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  26.79 
 
 
1208 aa  57  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.13 
 
 
1189 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.81 
 
 
1246 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.64 
 
 
1226 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.3 
 
 
737 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.89 
 
 
600 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  26.48 
 
 
1129 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.47 
 
 
1228 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.4 
 
 
574 aa  54.7  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  23.64 
 
 
1126 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.37 
 
 
891 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  29.82 
 
 
438 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.16 
 
 
1114 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.05 
 
 
574 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.39 
 
 
1170 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  31.65 
 
 
1161 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  28.51 
 
 
1166 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  28.57 
 
 
1120 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.65 
 
 
1838 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.41 
 
 
551 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.17 
 
 
1066 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.77 
 
 
1192 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  28.04 
 
 
828 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.41 
 
 
596 aa  50.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  23.96 
 
 
649 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  29.38 
 
 
645 aa  50.8  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  26.84 
 
 
1434 aa  50.4  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.5 
 
 
1490 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  22.16 
 
 
402 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.34 
 
 
3197 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  27.51 
 
 
524 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  32.45 
 
 
585 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.75 
 
 
1557 aa  48.5  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  23.97 
 
 
593 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  22.59 
 
 
1172 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  28.15 
 
 
472 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  23.86 
 
 
664 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  25.5 
 
 
1126 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.53 
 
 
453 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  28.67 
 
 
437 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  22.56 
 
 
499 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  27.07 
 
 
494 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2057  FG-GAP repeat-containing protein  34.48 
 
 
282 aa  44.3  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218774  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  28.03 
 
 
730 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.68 
 
 
1225 aa  43.5  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  23.13 
 
 
1348 aa  43.5  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  27.78 
 
 
702 aa  43.5  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>