55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0294 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  100 
 
 
685 aa  1399    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  99.42 
 
 
685 aa  1389    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  31.66 
 
 
681 aa  313  6.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  29.31 
 
 
499 aa  89.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  23.01 
 
 
593 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.71 
 
 
546 aa  77  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  20.93 
 
 
604 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.54 
 
 
574 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  23.24 
 
 
593 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  24.95 
 
 
1129 aa  70.5  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.16 
 
 
1228 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.28 
 
 
1236 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 
1127 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.13 
 
 
1246 aa  65.1  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.1 
 
 
600 aa  65.1  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  24.27 
 
 
604 aa  64.7  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  35.64 
 
 
878 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.65 
 
 
737 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  24.44 
 
 
569 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  25.21 
 
 
803 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  21.95 
 
 
649 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  20.75 
 
 
583 aa  61.2  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  22.89 
 
 
655 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.61 
 
 
585 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.79 
 
 
1170 aa  58.9  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  26.97 
 
 
556 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  28.81 
 
 
1575 aa  57.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  27.39 
 
 
1208 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  25.26 
 
 
1120 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  25.27 
 
 
645 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  35.66 
 
 
596 aa  55.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  23.81 
 
 
573 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.77 
 
 
1193 aa  55.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.48 
 
 
551 aa  55.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  27.14 
 
 
1098 aa  54.3  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  27.91 
 
 
562 aa  54.3  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 
1184 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  22.54 
 
 
1127 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  28.47 
 
 
577 aa  51.6  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.37 
 
 
1208 aa  51.2  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.39 
 
 
1189 aa  50.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.57 
 
 
1114 aa  50.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.44 
 
 
1225 aa  50.4  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  25.83 
 
 
1133 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.87 
 
 
1226 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  23.29 
 
 
574 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  26.09 
 
 
1113 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  21.31 
 
 
1109 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  35.16 
 
 
1172 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  28.93 
 
 
510 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  31.52 
 
 
1166 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  23.27 
 
 
691 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.36 
 
 
1192 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  26.4 
 
 
585 aa  44.3  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  31.58 
 
 
1183 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>