119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0919 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  100 
 
 
583 aa  1192    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  54.64 
 
 
604 aa  595  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  46.11 
 
 
556 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  49.17 
 
 
649 aa  485  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  45.08 
 
 
593 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  42.64 
 
 
573 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  40.32 
 
 
569 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  41.37 
 
 
551 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  40.67 
 
 
546 aa  344  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  37.85 
 
 
577 aa  341  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.57 
 
 
600 aa  334  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  39.49 
 
 
593 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  38.17 
 
 
562 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.59 
 
 
596 aa  313  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.67 
 
 
574 aa  306  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  33.56 
 
 
574 aa  248  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  34.43 
 
 
604 aa  244  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.57 
 
 
1236 aa  207  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.78 
 
 
585 aa  203  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.79 
 
 
1246 aa  199  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.11 
 
 
1193 aa  197  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.76 
 
 
1208 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.57 
 
 
1228 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.61 
 
 
1192 aa  188  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.1 
 
 
1225 aa  187  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.64 
 
 
1170 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  30 
 
 
1098 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.13 
 
 
1189 aa  177  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.59 
 
 
1226 aa  173  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.62 
 
 
1114 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  27.94 
 
 
1129 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  26.77 
 
 
1208 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  27.87 
 
 
1127 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  29.01 
 
 
951 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  28.08 
 
 
803 aa  151  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  26.57 
 
 
1109 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  29.26 
 
 
1120 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  27.41 
 
 
1203 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  27.53 
 
 
1183 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
1127 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  28.57 
 
 
1113 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  26.45 
 
 
1126 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  27.57 
 
 
1172 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  25.71 
 
 
1088 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  25.59 
 
 
1166 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.71 
 
 
737 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.17 
 
 
1066 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  27.98 
 
 
691 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  29.62 
 
 
1575 aa  127  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  26.02 
 
 
1161 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  26.89 
 
 
1107 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  25.04 
 
 
1098 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  29.26 
 
 
554 aa  113  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.14 
 
 
585 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  27.04 
 
 
492 aa  98.2  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.64 
 
 
453 aa  97.4  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.48 
 
 
521 aa  94  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.19 
 
 
668 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  25.61 
 
 
655 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  26.18 
 
 
499 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.72 
 
 
526 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.08 
 
 
657 aa  84.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.92 
 
 
638 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.75 
 
 
655 aa  83.6  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  23.15 
 
 
655 aa  80.5  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.23 
 
 
573 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  20.96 
 
 
645 aa  75.5  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  27.52 
 
 
1838 aa  72  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  25.14 
 
 
566 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.1 
 
 
677 aa  72  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.77 
 
 
1040 aa  71.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
1184 aa  71.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  25.7 
 
 
1133 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.58 
 
 
455 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  32.45 
 
 
878 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  22.57 
 
 
658 aa  67  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25.4 
 
 
1490 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  24.48 
 
 
1275 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  20.75 
 
 
685 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  25.97 
 
 
1124 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  20.75 
 
 
685 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  26.47 
 
 
566 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.34 
 
 
1222 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  25.21 
 
 
645 aa  61.6  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  26.83 
 
 
604 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  38.1 
 
 
646 aa  60.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.44 
 
 
1019 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  25.3 
 
 
469 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  24.46 
 
 
828 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  21.5 
 
 
667 aa  57.4  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.06 
 
 
1113 aa  57  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  20.95 
 
 
681 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.95 
 
 
891 aa  54.7  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  24.37 
 
 
730 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  25.29 
 
 
616 aa  53.9  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  26.83 
 
 
685 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  24.26 
 
 
974 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  27.76 
 
 
472 aa  50.8  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.57 
 
 
2807 aa  50.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  25.08 
 
 
872 aa  50.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>