58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0890 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  100 
 
 		 646 aa  1322    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  37.44 
 
 		 664 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  30.29 
 
 		 645 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  27.97 
 
 		 752 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  25.08 
 
 		 878 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.27 
 
 		 600 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.71 
 
 		 455 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  29.52 
 
 		 556 aa  68.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.84 
 
 		 1170 aa  67  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.85 
 
 		 1192 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.57 
 
 		 596 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  29.14 
 
 		 1126 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.53 
 
 		 546 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  35.96 
 
 		 1098 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  29.38 
 
 		 521 aa  58.9  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  25.26 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.61 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.07 
 
 		 526 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.88 
 
 		 574 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1575 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  29.73 
 
 		 492 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.17 
 
 		 585 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  27.72 
 
 		 499 aa  55.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  28.41 
 
 		 573 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  28.04 
 
 		 482 aa  53.9  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  35.65 
 
 		 562 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  27.97 
 
 		 574 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  36.45 
 
 		 649 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  28.35 
 
 		 1098 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  30.92 
 
 		 604 aa  51.6  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  23.33 
 
 		 1088 aa  51.2  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  23.65 
 
 		 1208 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  25.84 
 
 		 569 aa  50.8  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.76 
 
 		 737 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  25.97 
 
 		 1129 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  28.96 
 
 		 3197 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.57 
 
 		 11716 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1127 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  25.71 
 
 		 566 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  30.67 
 
 		 593 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.94 
 
 		 803 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 1184 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  35.05 
 
 		 604 aa  48.5  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  30.05 
 
 		 577 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  23 
 
 		 1183 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  24.74 
 
 		 1126 aa  47.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  27.27 
 
 		 1203 aa  47.4  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.03 
 
 		 1193 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  34.45 
 
 		 1120 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.95 
 
 		 1066 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  38.1 
 
 		 583 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  28.14 
 
 		 1109 aa  44.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  33.94 
 
 		 1275 aa  44.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  34.83 
 
 		 3197 aa  44.3  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.04 
 
 		 1226 aa  43.9  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  39.74 
 
 		 1019 aa  43.9  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  26.54 
 
 		 685 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>