95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4948 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  43.55 
 
 		 1208 aa  936    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  43.29 
 
 		 1127 aa  842    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  100 
 
 		 1183 aa  2428    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  37.95 
 
 		 1098 aa  673    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  40.7 
 
 		 1109 aa  741    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  40.11 
 
 		 1098 aa  743    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  40.47 
 
 		 1120 aa  766    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  38.12 
 
 		 1172 aa  704    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  38.52 
 
 		 1088 aa  722    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  38.59 
 
 		 1129 aa  726    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  36.65 
 
 		 1126 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  41.07 
 
 		 1113 aa  781    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  37.46 
 
 		 1166 aa  719    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  50.75 
 
 		 1203 aa  1208    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  38.44 
 
 		 1161 aa  729    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.39 
 
 		 1246 aa  610  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.76 
 
 		 1228 aa  603  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  37.64 
 
 		 1107 aa  602  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.61 
 
 		 1236 aa  582  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.72 
 
 		 1192 aa  580  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.15 
 
 		 1170 aa  576  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.81 
 
 		 1208 aa  571  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.72 
 
 		 1225 aa  545  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.35 
 
 		 1226 aa  541  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.64 
 
 		 1114 aa  520  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.87 
 
 		 1193 aa  507  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.3 
 
 		 1189 aa  445  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.64 
 
 		 596 aa  168  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  29.06 
 
 		 593 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  28.92 
 
 		 604 aa  166  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  29.23 
 
 		 573 aa  163  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  28.2 
 
 		 593 aa  161  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.33 
 
 		 1066 aa  161  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.05 
 
 		 546 aa  156  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  27.79 
 
 		 585 aa  153  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.33 
 
 		 551 aa  152  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  27.53 
 
 		 583 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  27.32 
 
 		 556 aa  136  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.95 
 
 		 574 aa  130  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  25.93 
 
 		 604 aa  130  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.17 
 
 		 600 aa  129  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  28.75 
 
 		 569 aa  127  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  28.08 
 
 		 649 aa  125  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  25.95 
 
 		 577 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  28.11 
 
 		 562 aa  119  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.77 
 
 		 554 aa  112  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  26.33 
 
 		 566 aa  108  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1127 aa  106  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  23.7 
 
 		 951 aa  101  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  24.96 
 
 		 803 aa  96.3  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.53 
 
 		 645 aa  93.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.12 
 
 		 668 aa  92.8  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.47 
 
 		 737 aa  92.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.82 
 
 		 638 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  26.45 
 
 		 655 aa  85.9  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.67 
 
 		 573 aa  84.7  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  23.85 
 
 		 574 aa  84.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  27.32 
 
 		 499 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.17 
 
 		 521 aa  83.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.96 
 
 		 1040 aa  82  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.1 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  25.54 
 
 		 655 aa  74.3  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  23.39 
 
 		 658 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  24.01 
 
 		 492 aa  70.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  32.04 
 
 		 878 aa  69.3  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.72 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  39.56 
 
 		 585 aa  67.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1575 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  26.91 
 
 		 691 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.22 
 
 		 677 aa  67  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 		 1138 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  23.42 
 
 		 667 aa  62.4  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.06 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  28.99 
 
 		 681 aa  61.6  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  29.93 
 
 		 482 aa  61.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  23.06 
 
 		 730 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6360  ASPIC/UnbV domain protein  24.73 
 
 		 657 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.300912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  23.7 
 
 		 566 aa  59.3  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  26.98 
 
 		 645 aa  58.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.17 
 
 		 655 aa  56.2  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.67 
 
 		 526 aa  53.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  26.22 
 
 		 590 aa  52.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 1184 aa  52.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  27.43 
 
 		 664 aa  51.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.85 
 
 		 2807 aa  49.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  26.16 
 
 		 768 aa  48.5  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  26.05 
 
 		 447 aa  48.1  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  24.72 
 
 		 604 aa  48.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  23 
 
 		 646 aa  47.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  31.07 
 
 		 1133 aa  46.2  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  25.72 
 
 		 1557 aa  46.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4733  hypothetical protein  23.92 
 
 		 506 aa  45.8  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  26.84 
 
 		 3197 aa  45.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  27.2 
 
 		 3197 aa  45.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  26.5 
 
 		 8871 aa  44.7  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>