85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3172 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  100 
 
 		 521 aa  1055    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  55.04 
 
 		 526 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  50 
 
 		 492 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  28.34 
 
 		 556 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.11 
 
 		 546 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  26.77 
 
 		 593 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  27.99 
 
 		 649 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  24.22 
 
 		 1129 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  23.41 
 
 		 1107 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.97 
 
 		 1066 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  28.1 
 
 		 593 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  26.45 
 
 		 573 aa  90.9  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  26.45 
 
 		 604 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.94 
 
 		 574 aa  88.6  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  22.39 
 
 		 1208 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  25.2 
 
 		 569 aa  87.4  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  25.17 
 
 		 1183 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  24.43 
 
 		 1203 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  27.1 
 
 		 1120 aa  84  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  27.15 
 
 		 566 aa  83.6  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  26.84 
 
 		 1098 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.96 
 
 		 600 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  23.35 
 
 		 1109 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  25.51 
 
 		 1127 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.04 
 
 		 1246 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  25.53 
 
 		 583 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  27.71 
 
 		 585 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.71 
 
 		 1040 aa  75.1  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.73 
 
 		 1114 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  24.62 
 
 		 577 aa  74.7  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  25.97 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  25.63 
 
 		 1088 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  27.67 
 
 		 604 aa  74.3  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.21 
 
 		 1189 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.73 
 
 		 737 aa  70.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  27.55 
 
 		 1166 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  24.62 
 
 		 1172 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  24.26 
 
 		 554 aa  68.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.91 
 
 		 645 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  25 
 
 		 803 aa  67.8  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.33 
 
 		 573 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  23.21 
 
 		 1113 aa  67.4  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.98 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.71 
 
 		 1192 aa  65.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  25.87 
 
 		 658 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  23.79 
 
 		 1161 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  24.34 
 
 		 691 aa  63.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  24.43 
 
 		 1098 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.38 
 
 		 1170 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  28.53 
 
 		 655 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  29.63 
 
 		 878 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  25.72 
 
 		 574 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.29 
 
 		 1236 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.06 
 
 		 657 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1127 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.18 
 
 		 1225 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.75 
 
 		 1228 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  29.38 
 
 		 646 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.44 
 
 		 1226 aa  57.4  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2651  ATPase  33.51 
 
 		 752 aa  57  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000453711  normal  0.013056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.29 
 
 		 596 aa  57  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  25 
 
 		 668 aa  57  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  26.47 
 
 		 1126 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.29 
 
 		 453 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.81 
 
 		 638 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  25.5 
 
 		 951 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  34.34 
 
 		 681 aa  50.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1575 aa  50.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.1 
 
 		 1193 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.54 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.79 
 
 		 1208 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  24.6 
 
 		 828 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  24.31 
 
 		 655 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  27.23 
 
 		 645 aa  47.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  24.76 
 
 		 499 aa  47.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.6 
 
 		 1340 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.19 
 
 		 889 aa  47  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  31.39 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.68 
 
 		 1225 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.83 
 
 		 655 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  26.32 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  24.37 
 
 		 2807 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.08 
 
 		 2194 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  23.57 
 
 		 730 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  30.38 
 
 		 1133 aa  43.5  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>