103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2275 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 
604 aa  1205    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  45 
 
 
593 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  38.32 
 
 
562 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.36 
 
 
546 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  34.6 
 
 
569 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  36.35 
 
 
573 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  35.25 
 
 
577 aa  250  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  38.01 
 
 
551 aa  246  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.09 
 
 
596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.18 
 
 
600 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  34.07 
 
 
556 aa  241  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  36.95 
 
 
574 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  33.76 
 
 
604 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  34.09 
 
 
649 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  32.6 
 
 
593 aa  233  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  34.36 
 
 
583 aa  224  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  32.55 
 
 
574 aa  188  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.7 
 
 
1246 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.58 
 
 
1192 aa  153  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.19 
 
 
1228 aa  153  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  31.09 
 
 
1098 aa  153  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.81 
 
 
1193 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.01 
 
 
1189 aa  147  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.28 
 
 
1226 aa  146  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.46 
 
 
1170 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  26.21 
 
 
1109 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.66 
 
 
1208 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.75 
 
 
1225 aa  131  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  25.93 
 
 
1183 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  27.59 
 
 
1129 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  38.79 
 
 
1126 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.6 
 
 
737 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  29.17 
 
 
1120 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
1127 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.6 
 
 
1114 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.38 
 
 
585 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.16 
 
 
1236 aa  118  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  26.08 
 
 
1208 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.67 
 
 
1066 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  29.51 
 
 
951 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  25.61 
 
 
1088 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  31.73 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  24.61 
 
 
1113 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  26.54 
 
 
585 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  30.91 
 
 
691 aa  104  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  25.52 
 
 
1098 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  27.76 
 
 
803 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  22.91 
 
 
1166 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  28.83 
 
 
1203 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  27.3 
 
 
1172 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  27.44 
 
 
1575 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  30.42 
 
 
1127 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  25.46 
 
 
1161 aa  97.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
1184 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  29.76 
 
 
554 aa  90.1  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  24.47 
 
 
1107 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.38 
 
 
655 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  25.16 
 
 
658 aa  82  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.61 
 
 
657 aa  80.5  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  26.43 
 
 
492 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  25 
 
 
655 aa  77  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  27.51 
 
 
521 aa  75.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  24.57 
 
 
645 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.99 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.57 
 
 
638 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.02 
 
 
677 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  27.52 
 
 
566 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  26.86 
 
 
768 aa  71.2  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.09 
 
 
645 aa  70.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  28.35 
 
 
730 aa  70.5  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  27.34 
 
 
878 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  28.38 
 
 
655 aa  68.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  24.27 
 
 
685 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  24.27 
 
 
685 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  30.74 
 
 
8871 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  27.08 
 
 
668 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  32 
 
 
664 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.78 
 
 
455 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  26.3 
 
 
1275 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.19 
 
 
526 aa  57.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  34.86 
 
 
1133 aa  57.4  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1941  hypothetical protein  23.98 
 
 
758 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  27.66 
 
 
566 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.46 
 
 
573 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.56 
 
 
1838 aa  55.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  26.46 
 
 
872 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  24.35 
 
 
590 aa  53.9  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  22.51 
 
 
681 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6354  FG-GAP repeat protein  36 
 
 
423 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.505611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  24.23 
 
 
1126 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  25.73 
 
 
3197 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  30.94 
 
 
616 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  27.12 
 
 
554 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  28.75 
 
 
4379 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  35.05 
 
 
646 aa  48.5  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0593  FG-GAP repeat-containing protein  27.07 
 
 
620 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.618289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  24.35 
 
 
1124 aa  47.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.5 
 
 
2194 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.69 
 
 
1040 aa  47.4  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.8 
 
 
1019 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>