129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0425 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  100 
 
 
569 aa  1165    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  42.35 
 
 
562 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  40.73 
 
 
649 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  41.65 
 
 
573 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  40.41 
 
 
556 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  39.69 
 
 
604 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  39.26 
 
 
577 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  41.54 
 
 
593 aa  360  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  38.21 
 
 
596 aa  348  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  42.61 
 
 
551 aa  345  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  39.63 
 
 
583 aa  344  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  40.18 
 
 
600 aa  343  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  40.99 
 
 
546 aa  340  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  38.37 
 
 
593 aa  331  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  37.78 
 
 
574 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  37.25 
 
 
574 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  34.96 
 
 
604 aa  270  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 
1127 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  31.03 
 
 
803 aa  184  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.88 
 
 
737 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.43 
 
 
585 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  28.34 
 
 
1098 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.03 
 
 
1193 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.76 
 
 
1208 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.15 
 
 
1192 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  29.33 
 
 
1120 aa  153  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30 
 
 
1170 aa  151  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.35 
 
 
1228 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.83 
 
 
1246 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  27.54 
 
 
1126 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.2 
 
 
1225 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  28.75 
 
 
1183 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.48 
 
 
1226 aa  143  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.19 
 
 
1114 aa  140  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  28.3 
 
 
1107 aa  140  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.38 
 
 
1236 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  27.24 
 
 
1109 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  26.33 
 
 
1088 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.48 
 
 
1189 aa  136  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  27.93 
 
 
1098 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  27.44 
 
 
1113 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  31.55 
 
 
1575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  25.57 
 
 
1127 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  24.87 
 
 
1129 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  23.21 
 
 
1208 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  29.33 
 
 
951 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  26.23 
 
 
1166 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.75 
 
 
1066 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  29.12 
 
 
691 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  28.96 
 
 
585 aa  113  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  25.95 
 
 
1203 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  25.87 
 
 
1161 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.51 
 
 
453 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  27.84 
 
 
499 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.84 
 
 
554 aa  100  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.44 
 
 
655 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.46 
 
 
455 aa  93.6  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
1184 aa  93.6  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  24.92 
 
 
1172 aa  87.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  25.91 
 
 
521 aa  82.8  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  25.05 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  31.77 
 
 
1838 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  24.54 
 
 
658 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.62 
 
 
3197 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  27.79 
 
 
1124 aa  73.9  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  27.46 
 
 
1126 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  27.41 
 
 
566 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  26.04 
 
 
590 aa  72  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  24.03 
 
 
667 aa  70.5  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  21.92 
 
 
668 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.11 
 
 
1490 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.59 
 
 
2807 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.29 
 
 
655 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.97 
 
 
677 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0294  integrins alpha chain  24.44 
 
 
685 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0294  integrins alpha chain  24.44 
 
 
685 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  26.75 
 
 
878 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  28.47 
 
 
469 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  29 
 
 
1275 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.16 
 
 
657 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  27.97 
 
 
3197 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.17 
 
 
616 aa  64.3  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  24.14 
 
 
681 aa  63.9  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  23.6 
 
 
566 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  28.67 
 
 
1557 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  27.16 
 
 
4379 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  24.93 
 
 
604 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.56 
 
 
573 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.3 
 
 
1019 aa  60.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 
1104 aa  60.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  23.12 
 
 
638 aa  60.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  24.95 
 
 
730 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  27.36 
 
 
386 aa  59.7  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  27.01 
 
 
974 aa  57  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  37.25 
 
 
646 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  25.26 
 
 
768 aa  56.2  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.67 
 
 
645 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  21.72 
 
 
655 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.74 
 
 
1040 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.86 
 
 
889 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>